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查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 单分子文件格式转换 创建分子或分子复合物批量下载任务 查询分子或分子复合物批量下载任务详情
结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小 表7 BoundingBox 参数 是否必选 参数类型 描述 center 否 Array of numbers 口袋中心坐标。 x, y, z轴的坐标 size 否 Array of numbers 口袋尺寸大小。x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表8 CustomProp
结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小 表7 BoundingBox 参数 是否必选 参数类型 描述 center 否 Array of numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size 否 Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表8
表7 BoundingBoxDto 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of floats 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋尺寸大小;
10 表7 DrugBoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标;x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小;x
run the notebook again!”时,请单击Notebook工具栏中的按钮,重启Notebook环境,并重新执行出现告警的代码。 您可以在Notebook工作目录中上传数据,使用AutoGenome工具。数据上传下载请参见数据的上传和下载。 对于非挂载目录以外的目录下的文
最大长度:10000000 表8 DrugBoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标;x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小;x
最大长度:10000000 表6 BoundBoxDto 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of doubles 口袋中心坐标,x、y、z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋尺寸大小,x、y、z轴的大小。
最大长度:24 表6 VertexLocationDto 参数 是否必选 参数类型 描述 x 否 Double 子任务的画布横坐标 y 否 Double 子任务的画布纵坐标 表7 TaskParameterDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 子任务的参数名称,长度为[1
最大长度:24 表6 VertexLocationDto 参数 是否必选 参数类型 描述 x 否 Double 子任务的画布横坐标 y 否 Double 子任务的画布纵坐标 表7 TaskParameterDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 子任务的参数名称,长度为[1
最大长度:10000000 表8 BoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小;
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter No
上传镜像前,您需要安装容器引擎并完成镜像的制作,详细操作请参考安装容器引擎、制作Docker镜像。如果您已经安装了容器引擎,请跳过该步骤。 下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构 health switch project
结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小 表11 BoundingBox 参数 参数类型 描述 center Array of numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表12 CustomProp
结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小 表10 BoundingBox 参数 参数类型 描述 center Array of numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表11 CustomProp
在EIHealth平台,创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出,对于由多个应用搭建出来的流程,命令行工具中通过指定不同应用间的输入输出关系,完成应用的连接。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建流程,创建好的流程将同步显示到EIHealth平台。 获取流程模板
新建流程 选择“工具>Nextflow”,单击“新建流程”。 填写流程基本信息。 名称:设置流程名称。名称长度为1-56,只允许出现中划线、下划线、字母和数字。 标签:选择流程标签,最多可添加5个。 描述:设置流程相关描述。 单击“下一步”,添加流程文件。 单击“流程文件”后面的“添加”,添加流程文件。
最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of floats 口袋中心坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size 是 Array of floats 口袋大小。 最小值:2
以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面,展开数据文件夹,选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。 单击鼠标右键,选择“链接另存为”,下载数据。 图1 下载数据 使用命令行工具下载数据 使用download命令将E
docker images命令查看已有的镜像。 详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 登录EIHealth平台,在镜像列表中查看已上传的镜像。 步骤4:创建应用 在“项目管理”页面“工具”页签中,单击“新建应用”。 填写应用的基本信息。 “名称”填写fastqc,“版本”填写v0