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Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 20 ligands 是 Array of LigandDto objects 配体文件列表,当前仅支持1个。 数组长度:1 - 1 engine 否 String 引擎,支
径样式为:path/;引用数据时目的存放路径为本项目的根目录,故无需指定destdir。 --md5s -m 否 网络下载链接对应的md5列表,值用; 分隔,和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
在调用接口的时候,部分URL中需要填入项目编号,所以需要获取到项目编号。项目编号获取步骤如下: 登录管理控制台。 单击用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 在“API凭证”页面的项目列表中查看项目ID。 图1 查看项目ID 调用API获取项目ID 项目ID通过调用查询指定条件下的项目信息API获取。
receptors Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 20 ligands Array of LigandDto objects 配体文件列表,当前仅支持1个。 数组长度:1 - 1 engine String 引擎,支持DS
下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
获取系统标签 使用get命令获取系统标签库列表。 命令结构 health get label [flags] 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health get label #
描述 count Integer 总数 resources Array of StorageResourceRsp objects 存储资源列表 表4 StorageResourceRsp 参数 参数类型 描述 spec SpecDto object 规格信息 size Long 使用量
在作业中心页面,可以创建分子对接、分子优化、自由能微扰、合成路径规划功能的作业。 在“作业中心”页面,以列表形式展示了项目中作业的运行状态。您可以查看作业的名称、创建时间、运行状态、总时长、运行时长、已运行时间、预计还需时间。对于列表中的作业,支持通过作业名称、状态、类型、标签、创建时间和完成时间进行快速搜索
在“项目管理”页面“作业”页签中,以列表形式展示了项目中运行的分析作业和运行状态。您可以查看分析作业名称、标签、所使用的流程名称、版本、运行状态、创建者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执行重试、取消、删除、克隆、导出操作。对于列表中的作业,支持通过作业名称、流程名称、标
代表从哪个位置开始。默认为0。此参数用于获取作业列表。 --jobName -j 否 作业名。此参数用于获取作业列表。 --labels -a 否 按标签筛选列表,标签间用, 分隔。例子:label1,label2。此参数用于获取作业列表。 --status -s 否 作业状态。此参数用于获取作业列表。 取值:CA
任务id,如果不传,那么获取的是任务列表。 --type -t 否 查询类型。 默认detail。 取值:logs、detail 。 logs:获取task日志。 detail:获取task详情,用于获取task列表。 --jobId -j 是 作业Id。 命令示例 获取task列表 health nextflow
表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 quotas Array of QuotaRsp objects 配额信息列表 count Integer 配额列表个数 表4 QuotaRsp 参数 参数类型 描述 name String 配额项名称,支持USER,PROJECT,USER_PROJECT
PocketFragment objects 配体文件列表,最多支持1个。 数组长度:0 - 1 num_trials 否 Integer 生成分子数量。 最小值:1 最大值:5000 缺省值:1000 model_ids 否 Array of strings 模型id列表。 最小长度:1 最大长度:128
count Integer 总数 resources Array of ComputingResourceRsp objects 计算资源列表 表4 ComputingResourceRsp 参数 参数类型 描述 id String 实例ID resource_id String
count Integer 总数 resources Array of DatabaseResourceRsp objects 数据库资源列表 表5 DatabaseResourceRsp 参数 参数类型 描述 id String 实例ID resource_id String 资源ID
count Integer 总数 resources Array of PerformanceResourceRsp objects 性能加速资源列表 表4 PerformanceResourceRsp 参数 参数类型 描述 id String 实例ID resource_id String
source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据
是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数
smiles_list Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10 - 10000 molecule_file DrugFile object 分子文件,分子表达式列表和分子文件二选一,分子文件优先级最高。 num_trials Integer
smiles_list 否 Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10 - 10000 molecule_file 否 DrugFile object 分子文件,分子表达式列表和分子文件二选一,分子文件优先级最高。 binding_sites