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{ "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建分子搜索作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。 { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "limit_concurrency"
API概览 医疗智能体平台所提供的API,均符合RESTful API设计规范,如表1所示。 临床研究和药物设计所提供的API,均符合RESTful API设计规范,如表2所示。 表1 医疗智能体平台API 类型 API 说明 项目管理 项目管理 项目创建、获取项目详情、删除项目等相关操作API。
"id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建分子属性预测作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。 { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "limit_concurrency"
排序方向,升序或降序,即ASC 和DESC,默认DESC,只有在--data参数使用时才生效。 --columns -c 否 当某个数据库实例列数非常多时,查看数据时会由于机器显示界面限制导致换行难以查看,添加此参数可以只显示想要查看数据的列名,多个列名用分号隔开(;),只有在--data参数使用时才生效。
QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。 聚类分析 目前分子属性预测返回的结果小分子数较多,无法进行批量分析,通过一些聚类的辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证,提高分析的效率和分析质量。也可
置为目标对象元数据x-obs-md5chksum,用于下载或复制时校验MD5。 --parallel -p 否 每个分段复制任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultParallels。 --threshold -t 否 开启分段复制任务的阈值,单位:字节,默认为配置文件
值设置为对象元数据x-obs-md5chksum,用于下载或复制时校验MD5。 --parallel -p 否 每个分段上传任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultParallels。 --threshold -t 否 开启分段上传任务的阈值,单位:字节,默认为配置文件
01040015 The number of columns set as primary keys cannot exceed 10. 检查设为主键的列数是否超过了10个。 400 eihealth.01040016 Operations on built-in databases are not
如果目标对象与源对象大小以及修改时间都一致,此时会直接删除源对象,而不进行移动操作。 --parallel -p 否 每个分段移动任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultParallels。 --threshold -t 否 开启分段移动任务的阈值,单位:字节,默认为配置文件
新建流程 流程说明 分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 EIHealth中的流程由应用搭建形成,应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义,包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。
购买存储套餐包 存储资源支持用户购买套餐包。存储资源包不能退订,不能抵扣已经产生的用量。您可以单击右上角“查询详情”,查看套餐包的具体使用量。 在平台右上角单击用户名,选择“系统资源”>“存储资源”。 在存储资源页面选择“套餐包”,单击“购买存储套餐包”。 图1 购买存储套餐包 填写套餐包的信息。
创建分析作业 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击NGS流程行的“启动作业”。 请参考配置输入和依赖数据章节,设置NGS流程数输入数据。 在新建作业页面,填写作业信息。 基本信息:包含作业名称、标签、描述。 输出路径:存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的o
购买资源 盘古辅助制药平台购买完成后,单击“进入平台”,在平台右上角单击用户名,选择“资源中心”。 您可以根据实际需求选择购买功能调用套餐包和存储套餐包。在后续使用过程中,也可根据使用情况随时购买资源。 资源中心 在“资源中心>功能调用”中可以查看功能调用套餐包的使用情况。 图1
创建自动作业 针对存在需要批量创建分析作业的场景,您可以选择创建自动作业。 在“自动作业”页签,您可以查看已创建的自动作业,包含作业名称、状态、数据表、创建者、创建时间;在操作列,您可以对已创建的自动作业执行启动、编辑、删除操作,运行中的作业可以执行停止操作。 图1 自动作业 前提条件
使用Variant Calling Based On NGS流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时,大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。
使用Docking Summary流程 分子对接(molecular docking )是分子模拟的重要方法之一,其本质是两个或多个分子之间的识别过程,其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。分子对接方法在药物设计、材料设计等领域有广泛的应用。 在药物分子产生药效反应的过程中,药
不同类型的归档,费用分别是多少? 选择归档存储类别涉及以下三种计费: 归档类别数据的存储费用 恢复归档数据的流量费用 提前删除归档数据(不满90天)收取的费用 存储类型 存储空间(按需) 存储套餐包(1TB 1年) 数据取回(直读) 数据取回(加急/标准) 删除对象 标准存储 0
如果需要设置官能团的约束,可以在约束条件中设置“Substructure”,然后选择“包含”或者“排除”,包含官能团或者去除官能团条件,设置1个官能团数为佳。在官能团设置中,可以单击蓝色按钮来设置生长方向,即我们所生成的分子只会往我们所标记的方向生长。如果在一个Substructure约束条
启动作业 通过使用create或 submit命令引用本地的配置文件,启动分析作业。 命令结构 health create job [flags] # create和submit作用相同 health submit job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明
什么是医疗智能体eihealth-toolkit 医疗智能体命令行工具(eihealth-toolkit)是配套EIHealth平台,为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具,可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。