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越不容易清除。 Vina score 靶点口袋分子设计后的分子的vina score分数。 similarity 靶点口袋分子设计后的分子与原始分子的相似度，计算的是ECFP4 Tanimoto相似度。 score 优化后小分子的综合打分。 Vina Score1 分子优化如果
约束与限制 使用区域限制 医疗智能体目前支持的区域为“华北-北京四”、“华东-上海一”、华南-广州。 盘古辅助制药平台仅在“华东-上海一”支持。 不同区域云服务产品之间内网互不相通；请就近选择靠近您业务的区域，可减少网络延迟，提高访问速度。 平台用户权限限制 EIHealth平台
对测序得到的fastq数据进行质控。 trimmomatic 使用trimmomatic工具去掉测序接头，得到去接头后fastq格式的reads。 star 使用STAR比对工具将去接头后的reads比对到参考基因组，得到bam文件和多种格式的统计报告。 使用RNA-Seq流程的详细步骤如下所示：
流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具，详细介绍请参见流程设计器。新建流程时，自动保存默认打开。 图1 新建流程 填写流程参数信息，填写完成后单击“确定”。 填写流程基本参数，包括“流程名称”、“版本”、“标签”、“短描述”和“描述”。 “流程名称”和“版本”为必填项，其他参数可选填。
输出的insert size分布的pdf文件。 参数填写无误后，单击界面上方“启动作业”，运行作业。 步骤4：查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业”页签，单击创建的NGS作业名称，进入详情页，查看执行结果。 图2 执行结果 作业运行完成后，单击应用进度条中的“输出参数”，可跳转至数据所在路径，获取运行结果数据。
请先参考上传数据，上传原始Fastq文件和依赖数据。 如果在创建应用时打开了“并发”开关，可以设置多个参数值，批量执行作业。 数据上传完成后，在流程设计器页面，分别单击应用参数左侧图标，设置输入和依赖数据。NGS流程中输入输出参数说明如表2所示。 表1 流程输入、输出和依赖 类别
作业执行失败排查思路 作业执行失败，有如下场景： 场景1：作业投递后处于运行中，运行过程正常，但是最后超时失败。 场景2：作业投递后处于运行中，但是无日志打印，也没有任何符合预期的输出文件生成。 场景3：作业投递后显示运行成功，但是根据日志分析作业有报错，也未能正确输出相关信息。
生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果支付时间晚于指定生效时间，资源包将在支付后立即生效。 图2 购买套餐包 设置完成后，单击“立即购买”，然后单击“确认”。 在云服务订单页面，单击“确认付款”。 购买成功后，可以在“套餐包”页面查看套餐包信息。
平台节点最大规格 app_infos Array of AppFilterDto objects 筛选后的app集合 job_info JobFilterDto object 筛选后的job 表9 AppFilterDto 参数 参数类型 描述 app_id String 应用id
持处理。 单击“下一步”，设置角色。设置是否为“系统管理员”。 配置完成后，单击“确定”。 等待导入成功后，单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用户，不支持删除，只支持移除，移除后不影响该用户操作其他服务。 图2 查看导入用户 医疗平台用户会在IAM中
用户资源配额：设置用户的个人资源配额。详细请参考个人资源配额。 配置完成后，单击“确定”。 等待导入成功后，单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用户，不支持删除，只支持移除，移除后不影响该用户操作其他服务。 图3 查看导入用户 医疗平台用户会在IAM中
关键概念 镜像 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平
一步高级配置”。 图4 网络配置 单击“下一步：高级配置”，在弹窗里单击“确认”。 图5 确认 高级配置。 图6 高级配置 确认配置，无误后单击“立即创建”，即可完成购买。 图7 确认配置 父主题： 准备工作
访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全，访问密钥仅在初次生成时自动下载，后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 获取区域名称 区域是一个地理区域的概念，由于带宽原因，会在多个地区建立数据中心，提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四，区
访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全，访问密钥仅在初次生成时自动下载，后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 获取区域名称 区域是一个地理区域的概念，由于带宽原因，会在多个地区建立数据中心，提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四，区
访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全，访问密钥仅在初次生成时自动下载，后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 获取区域名称 区域是一个地理区域的概念，由于带宽原因，会在多个地区建立数据中心，提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四，区
在项目设置页面，可以查看项目名称，该项目的数据存储OBS桶名称。所有者可以修改项目描述，转移项目，删除项目。管理员可以修改项目描述，退出项目。操作员可以退出项目。 删除项目后数据、作业会同步删除，删除项目不可逆，请谨慎操作。 成员管理 在成员管理页面可以添加或者移除访问该项目的成员。 图3 成员管理 数据审计 平
目时，才可以被删除。在用户的操作列，单击“删除”，删除对应的用户。 图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户，不支持删除，只支持移除。移除后不影响该用户操作其他服务。执行移除用户操作时，只有在该用户名下没有项目时，才可以被移除。在用户的操作列，单击“移除”，移除对应的用户。 图2
类型为bash：操作与Linux系统相同。 类型为zsh：执行history -p命令清除历史记录，重新登录命令行工具后，记录可恢复。执行rm -rf ~/.zsh_history命令，退出终端后再次执行history -p命令可删除记录文件，清空历史。 windows系统：对于当前执行的命令，可通过关闭cmd窗口实现历史命令的清理。
sk/token/endpoint。 开启该模式后，会占用上传和下载的双向带宽。 --fr -R 否 同步上传文件时生成结果清单文件。同步上传文件时该参数可选。 --arcDir -g 否 同步上传文件成功后的归档路径，上传成功后的文件会移动到该本地路径下。 --dryRun -y
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