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配额管理 为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”,查看配额。 图1 配额管理 父主题: 用户指南(基因平台)
计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用和作业都配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。
平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从
优先级:运行优先级,分为0~9级,优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。 如果当前投递的IO加速的作业,超过sfs总的作业配额数, 那么超出部分的作业会按照投递时间顺序,从最新投递的向前执行,不会按照优先级进行运行。 计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节
平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从
您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 EIHealth平台用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置,可创建平台的子用户,并为其分配权限。详细介绍请参见用户管理。 项目级别用户管理 资源级的角色配置,以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组,以便
Access Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 图1 我的凭证入口
生相互作用,继而通过适当的构象调整,得到一个稳定的复合物构象,通过分子对接确定复合物中的两个分子正确的相对位置和取向,研究两个分子的构象特别是底物构象在形成复合物过程中的变化,是确定药物作用机制,设计新药的基础。 分子对接计算是把配体分子放在受体活性位点的位置,然后按照几何互补、
平台通过云审计服务(CTS)提供操作记录的收集、存储和查询,审计操作可以设置导出用户的读操作和写操作(默认)和仅写操作(可选),保存周期可以设置需要保存的审计日志的保存周期,下载按钮可以下载最近7天内最新的1万条数据审计日志,查看按钮可以查看及下载保存的审计日志。 通过审计日志可用于支撑
Access Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 图1 我的凭证入口
Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 您在使用命令行工具时,需要使用AK/SK进行身份验证。 操作步骤 登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。
目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号和密码信息。在用户操作列,单击“安全设置”,重置用户的相关信息。 图3 重置用户信息 配额设置 您可以对用户管理中的某个用户设置配额。在用户操
最小值:2 最大值:500 数组长度:3 - 3 padding 是 Float 口袋的padding值。 最小值:0 最大值:20 响应参数 无 请求示例 设置口袋中心位置、大小和padding的值生成可渲染的口袋文件内容。 https://{endpoint}/v1/{project_
rings,分子环的数量,最佳在0~6之间。 MaxRing: Number of atoms in the biggest ring,最大环的原子数,最佳在0~18之间。 nHet: Number of heteroatoms,杂原子的数量,即非碳原子和氢原子的原子数,最佳在1~15之间。
分子搜索 可自定义数据库,以用户输入的参考化合物结构为起点,可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序,可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片,进入分子搜索页面。 在配置页面,进行分子搜索配置,包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面
计算节点id。设置了--label后使用,获取某个计算资源节点下的标签列表。 --zone -z 否 可用区id。如:cn-north-7c。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取计算资源列表
续费 购买的资源到期后,您可以进行续费以延长有效期,也可以在购买时勾选到期自动续费。续费相关操作,请参见续费管理。 到期与欠费 如果购买资源到期或者账号欠费,会根据“客户等级”和“订购方式”定义不同的保留期时长,保留期内您将不能进行资源访问,保留期内资源处理和费用详见“保留期
├─eihealth-project-name # 引用的项目名 │ ├─path1 # 引用的项目的源路径 ├─OBS:obs-bucket-name # 引用的外部桶名 │ ├─path1 # 引用的外部桶的源路径 ├─OBSFS:obsfs-bucket-name:
MD引擎:仅支持GROMACS。 时间步长:MD模拟的时间步长,范围支持0<时间步长≤5fs,默认是2fs。 温度:MD模拟的温度,范围支持0<温度≤1000K,默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy Minimization:能量最小化的步数,范围支持0<步数≤50000,默认是10000步。
summary:汇总分子对接结果。 图4 数据路径和流程图 图5 设置数据库 设置完成后,单击“提交”,执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务,允许取消、强制停止或删除。 图6 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计出结合能的均值和标准差。单击热点图,可查看详细的3D分子对接结果、结合能排序、药物注释信息。