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件的资源规格情况下,高优先级的先于低优先级投递。如果资源不满足,则优先处理资源满足的作业。例如,资源有2u2g,低优先级的需要1.8u1.8g,高优先级的需要2.2u2.2g,则低优先级的会先投递。但是两者都是1.8u1.8g,高优先级的先投递。 图1 新建作业 单击“确定”,进入启动作业页面。
来的OBS类型数据。 使用URL导入数据 使用URL方式将公网http/https/ftp链接的数据或者OBS中的数据导入。 单击数据中心右上角“URL导入”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用URL导入 父主题:
列举对象 使用ls命令查询EIHealth项目中的对象,返回的对象名称按照字典序排列。同时,该命令支持显示引用的其他项目的数据。 在使用该命令前,需要使用switch命令进入待操作的项目,才可以执行数据相关操作,使用逻辑与EIHealth平台相同。 命令结构 health ls <path>
创建Notebook 在开始进行模型开发前,您需要创建Notebook,并打开Notebook进行编码。 在“项目管理 > 开发”页面,单击“创建Notebook”,参考表 参数说明填写信息。 图1 创建Notebook 表1 参数说明 参数名称 说明 名称 Notebook的名
String 子任务实际名称,取值范围[1,32],只能以大小写字母开头,由大小写字母、数字、中划线(-)、下划线(_)组成,以大小写字符或数字结尾。需要和已有子任务的名称一致。 最小长度:1 最大长度:32 inputs 否 Array of TaskParameterDto objects
的OBS类型数据。 使用URL导入数据 使用URL方式将公网http/https/ftp链接的数据或者OBS中的数据导入。 单击“添加数据”,类型选择“URL”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用url导入数据
nux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 移动文件夹 示例1:将tmp文件夹中的所有文件移动至t1文件夹下,命令中tmp文件夹结尾需要加“/”,t1文件夹结尾无需加“/”。 health mv /tmp/ /t1 -r -f --dryRun # 返回结果如下 Start
使用分类标签功能,筛选呈现带有相同标签的应用或流程。 在“工具”页面左侧,单击图标新建分类标签。 在添加分类标签弹窗中,输入“名称”,勾选需要呈现的标签名称。最多可以勾选5个标签。 图1 添加分类标签 勾选完成后单击“确定”。 页面自动筛选出带有所选标签的应用或流程。 图2 添加完成
平台之间进行迁移,并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的程序模型,因此不用自己去写复杂的并行化的程序,只需要关注“数据流”即可。流程中的每个process可以通过配置文件快速的定制并行执行的样本数目,大大节约了生信人员搭建组学分析流程的时间。 医
查询的监控资源对象id,当查询存储资源和计算节点资源中的集群监控数据时,不需要填写资源id 最小长度:1 最大长度:128 device_id 否 String 显卡id,仅查询裸金属节点的gpu监控时,需要指定 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表3 请求Header参数
调用说明 医疗智能体平台提供了REST(Representational State Transfer)风格API,支持您通过HTTPS请求调用。 调用方法请参见如何调用API。 父主题: 使用前必读
MILES不支持输入空格或者中文。 选择基模型:选择基模型,此参数只有专业版支持。基模型列表见AI建模。 选择属性模型:选择AI模型。如果需要创建模型,可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。属性模型的基模型必须与上一步所选择的基模型一致。 输出小分子
点标签,不可修改。GPU包含NAIDIA架构GPU和自研的D310+ARM。选择GPU资源时,需要您在购买平台时包含了GPU资源,并且需要应用支持GPU运行。选择D310+ARM时,需要应用支持ARM环境运行,并在创建应用时,镜像系统为ARM类系统。 运行分析作业时,流程中的每一
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
、“短描述”和“描述”。 图2 基本信息 选择镜像和镜像版本。 详细的镜像介绍和制作方法请参见镜像管理。 填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量,并以大括号扩起,以$符号进行引用。 镜像启动命令支持多行输入,每行最多256字符,最多支持300行。 例如,b
String 子任务实际名称,取值范围[1,32],只能以大小写字母开头,由大小写字母、数字、中划线(-)、下划线(_)组成,以大小写字符或数字结尾。需要和已有子任务的名称一致。 最小长度:1 最大长度:32 inputs 否 Array of TaskParameterDto objects
单击“新建作业”,在弹出的新建作业页面,填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”,选择需要执行的流程,设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”、“加速类型”。 基本信息:包含作业名称、标签、描述。 流程名称:选择需要执行的流程。 输出路径:存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目
项目管理常用操作 对项目执行冻结、解冻、转移、分享和删除操作时,需要项目成员具备相应的权限,不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结:冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止,此时可以将项目暂时冻结,待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目,用户无法进入该项目
使用“导入应用”功能,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入应用”,进入导入应用页面。 图1 导入应用 选择需要引用的项目以及项目中的应用,选择应用的版本。“导入应用名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。 图2 导入应用 单击“确定”,导入应用
分析作业管理简介 分析作业依托于流程运行,需要您先创建流程,再基于流程创建分析作业。 在“项目管理”页面“作业”页签中,以列表形式展示了项目中运行的分析作业和运行状态。您可以查看分析作业名称、标签、所使用的流程名称、版本、运行状态、创建者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执