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Nextflow引擎生命周期管理 安装Nextflow 查询Nextflow配置详情 卸载Nextflow 清理Nextflow缓存 查询Nextflow版本列表 父主题: Nextflow接口
数据控制与数据审计 数据保护策略 项目内的数据支持精细化的权限控制,可对数据分享、下载、删除进行设置。您可以在项目的“设置”页面设置数据权限。数据权限仅可以有项目所有者设置。 分享:关闭分享后,项目内数据不允许分享给其他项目,包括拷贝、引用两种方式。 下载:关闭下载后,项目内数据不允许下载至本地。
命令行工具概述 医疗智能体命令行工具(eihealth-toolkit)是配套EIHealth平台,为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具,可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 eihealth-toolkit具备灵活性高、扩展性强:
最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 bucket_lifecycle Integer 追踪器配置转储生命周期 data_event Array of strings 追踪器配置监听事件 请求示例 查询项目追踪器 https://eihealth
配置命令行工具 医疗智能体平台命令行工具(eihealth-toolkit)是配套EIHealth平台,为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具,可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 操作步骤 下载命令行工具。 安装命令行工具。
上传镜像到SWR镜像仓库 上传镜像前,您需要安装容器引擎并完成镜像的制作,详细操作请参考安装容器引擎、制作Docker镜像。如果您已经安装了容器引擎,请跳过该步骤。 下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构
"versions" : [ "22.10.4" ] } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: Nextflow引擎生命周期管理
ean-cache 响应示例 无 状态码 状态码 描述 202 ACCEPTED 错误码 请参见错误码。 父主题: Nextflow引擎生命周期管理
27EA8AE05F327" } 状态码 状态码 描述 202 ACCEPTED 错误码 请参见错误码。 父主题: Nextflow引擎生命周期管理
错误码(医疗智能体与盘古辅助制药平台) 当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.01040001 Invalid template content. 检查模板内容是否符合格式要求。
请求示例 无 响应示例 无 状态码 状态码 描述 200 OK 202 ACCEPTED 错误码 请参见错误码。 父主题: Nextflow引擎生命周期管理
"progress" : 0.75 } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: Nextflow引擎生命周期管理
默认值:/picard-insertsize.txt 参数2 参数名称:insertsize-pdf 数据类型:File 必传:是 默认值:/picard-insertsize.pdf 表3 gatk-markduplicates、gatk-bqsr应用参数说明 应用名称和版本
Nextflow接口 Nextflow引擎生命周期管理 Nextflow作业管理 Nextflow任务管理 Nextflow流程管理 父主题: API(医疗智能体平台)
输出参数 insertsize-txt file 输出的insert size分布的文本文件。 insertsize-pdf file 输出的insert size分布的pdf文件。 gatk-markduplicates 输入参数 bam-file file 输入比对之后经过sort的bam文件。
容器镜像服务(SWR) 容器镜像服务(Software Repository for Container,简称SWR)是一种支持镜像全生命周期管理的服务,提供简单易用、安全可靠的镜像管理功能,帮助您快速部署容器化服务。 医疗智能体使用SWR存储工具镜像,包括内置工具及自定义工具的存储。
输出参数 insertsize-txt file 输出的insert size分布的文本文件。 insertsize-pdf file 输出的insert size分布的pdf文件。 参数填写无误后,单击界面上方“启动作业”,运行作业。 步骤4:查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业
od的phase映射,即容器以非0状态退出或者被系统终止会算作失败;容器return 0并且不再重启即算成功。详细内容介绍请参见Pod的生命周期。 处理建议 所有的算法程序的入口main函数都显式的给出返回值,即正确执行则return 0。其他异常场景return其他数值或者抛出异常,并输出相关日志。