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初始化分子集合 binding_site 否 表6 object 结合位点 custom_props 否 Array of 表8 objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 MoleculeConstraint 参数 是否必选 参数类型 描述 name 否 String 属性名称 type
BindingSite object 结合位点 custom_props 否 Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 MoleculeConstraint 参数 是否必选 参数类型 描述 name 否 String 属性名称 type
一个名称。同时，若想比较好的方式管理输出文件，也可以自行指定输出路径。 图6 新建作业 在作业页面添加好运行参数，添加方式与方式1相同。 配置好参数后，单击右上角“启动作业”按钮启动作业，同时会跳转回作业列表。 图7 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 查看方法与方式1相同。
设置picard-insertsize输入数据 若是想查看已经设置好的参数，可以按照下图步骤进行查看，同时若发现指定的参数有问题，也可再此处进行删除参数。 图11 删除参数 配置好参数后变可以单击右上角“启动作业”按钮进行启动作业，同时会跳转回作业列表。 图12 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 在
用于让应用调度到设置了该标签的节点上。 标签数量取值范围[0,1]。单个标签最大长度为63字符，必须以health.开头。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 如果同时使用yaml模板和参数命令对描述、标签等参数进行了修改，最终修改结果以参数命令为准。 对于可选参数，如果命令中包含了特殊字符，需使用""括起来。
导入文件列表，多个文件用分号(;)分隔，导入数据到数据库时此参数必填。 --current-project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
月。 单击“下一步”，确认订单详情。 单击“立即购买”，并支付订单，完成服务购买。 购买成功后，需要大约30分钟时间完成服务自动部署，请耐心等待。部署完成后，您可以使用注册的华为账号使用医疗智能体平台。 父主题： 准备工作
网络下载链接对应的md5列表，值用; 分隔，和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
分子SMILES表达式。 最小长度：1 最大长度：512 params SynthesisParamDto object 合成路径规划作业配置。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称，取值范围：[1,
ws-x86_64.zip.sha256。 安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。 获取Windows版本的命令行工具，得到health.exe文件，health文件无需安装，放置在任一文件夹中即可。 图1 下载命令行工具
式。 图2 输入分子 单击“下一步”，进入靶点设置，此步骤为可选步骤，如果需要设置靶点，并且将对接结合能作为一个约束条件进行优化，需要进行配置。最多可添加2个靶点。在添加靶点后，会进行单分子预对接，可查看Top1的对接打分与构象。 如果不需要设置靶点，此步骤可以进行省略，如果设置了靶点，作业运行时间会加长。
月。 单击“下一步”，确认订单详情。 单击“立即购买”，并支付订单，完成服务购买。 购买成功后，需要大约30分钟时间完成服务自动部署，请耐心等待。部署完成后，您可以使用注册的华为账号使用医疗智能体平台。 父主题： 准备工作
install 按Esc键，并执行:wq保存并退出Dockerfile。 制作镜像。 docker build -t bwa_samtools:0.7.17-1.10 . 制作gatk-haplotypecaller镜像 在本地搭建Docker环境。 要求安装的容器引擎版本必须为1
-y 否 查询提供时间以前的所有任务。例如，2006-01-02 15:04:05。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
显示示例yaml文件内容，以yaml格式打印到控制台，需要直接获取示例文件可使用Linux输出流重定向。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
data_disk_size 否 Integer 额外数据盘大小 最小值：100 最大值：32768 cpu_rule_enable 是 Boolean 是否启用cpu规则 cpu_percent 是 Integer cpu分配率百分比 最小值：1 最大值：100 add_nodes_for_cpu_rule
示想要查看数据的列名，多个列名用分号隔开(;)，只有在--data参数使用时才生效。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
--downloadPath -d 否 获取应用详情时，将内容下载到的指定文件夹路径（文件夹需要存在）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索应用。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-tool
-b 否 列举结果中字节数的显示格式。取值范围[human-readable, raw]。 如果未设置该参数，则列举结果中字节数的显示格式由配置文件中的humanReadableFormat参数决定。 --format -F 否 指定以自定义格式打印列举结果。当前仅支持值[default]，指定列举结果在一行显示。
有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理，实现高效的调用，极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像
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