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单击“下载3D”可以下载小分子或复合物。 单击“查看详情”可以直观查看小分子的结合能和属性信息。 图11 查看详情 分子对接结果支持以卡片视图的形式进行查看,参考图12,在卡片视图中: 图12 查看输出结果(3) 单击右上方的选择下拉框,可以选择分子的排序方式,将分子按照所选的排序方式进行展示。 图13
明。 图2 查看结果(1) 分子属性预测结果支持以卡片视图的形式进行查看,参考图3,在卡片视图中: 单击右上方的选择下拉框,可以选择分子的排序方式,将分子按照所选的排序方式进行展示。 图3 查看运行结果(2) 图4 排序方式 单击每个分子卡片右上方的,可以选择“查看详情”、“下游分析””。
操作等信息。 图2 查看属性模型列表 查看模型指标 查看loss值:loss代表模型训练的损失变化。 单击相应模型操作列的“查看loss”即可查看相应的训练集Loss。 删除模型:单击相应模型操作列的“删除”,在弹窗中单击“确定”,即可删除掉对应的模型。 查看评价指标:在模型列表
流程的子任务展示名称 output_dir String 子任务的输出存放路径 whole_output_dir String 子任务的完整输出路径,查看流程不会返回,查看作业时才会返回完整输出路径 io_acc_type String 子任务使用的IO加速类型,不填表示不使用; resources
图3 查看靶点口袋发现运动轨迹 查看2D相互作用图。 在“作业中心”单击作业名称,在输出结果页面右侧口袋列表,单击口袋后面的图标,然后单击查看2D相互作用图即可。 图4 查看2D相互作用图 查看作业信息图。 在“作业中心”单击作业名称,单击“作业信息”页面。可以查看作业的参数和运行信息。
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码:
创建、导入 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 启、停 √ √ √ - - 数据库 创建、导入、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 药物虚拟筛选 创建、修改、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 项目列表中只显示您所在的项目。 一个用户可以是多个项目的成员。
创建时间、更新时间和可执行的操作。 图2 项目列表 查看项目详情 项目详情提供了项目中数据大小、成员、创建时间等信息,您可以通过以下两种方式查看项目信息。 查看项目概览 单击项目名称左侧图标,或双击项目行中的空白处,展开项目概览页面。您可以在该页面查看项目的描述、标签、创建时间、
查询归档列表 功能介绍 分页查询用户管理的项目的所有历史归档记录 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/eihea
与靶点的结合构象。 如果上传了双靶点,可以通过切换来切换靶点,查看相应靶点和优化后分子的结合构象。如果设置了两个靶点会默认下载两个靶点的结果。 图14 查看3D图 在查看3D的页面中,单击右侧的配体列表中,每个配体卡片右上角的,可以查看 查看详情:可以查看每个分子的属性信息,score和similarity。
提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。 查看多对多运行结果。 如果是多受体对多配体,打开作业结果页面可以看到结合能二维矩阵,支持分别按照靶点和小分子进行排序。 图4 查看结果(1) 查看一对多运行结果。 单击受体结合能框,跳转到单受体对多配体的结果表页面,可以下载全量及单条CPI预测结果。
设置FEP参数 单击“提交”,可在作业中心查看该作业的运行情况。 查看运行结果。 输出每对配体的相对结合自由能、分子图、相似性等。也可以单击右边“查看轨迹”,下载运动轨迹。结果页面支持Pair和Ligand两种查看方式。 也可以下载输出结果文件包含小分子的基本信息和属性。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。
如果上传了双靶点,可以通过切换来切换靶点,查看相应靶点和生成分子的结合构象。如果设置了两个靶点会默认下载两个靶点的结果。 图11 查看3D图 在查看3D的页面中,单击右侧的配体列表中,每个配体卡片右上角的,可以查看 查看详情:可以查看每个分子的属性信息和score。 查看属性:查看每个分子的基本属性。 查看2D相互
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码:
查询数据列表 功能介绍 查询指定目录下的数据列表,如果不指定默认查询根目录 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/
查询流程 使用get命令查询流程的详细信息,该命令同时可以用于获取流程模板。 命令结构 health get workflow ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 否 不选此参数时,列出当前所在项目的所有流程信息。 指定workflow-i
引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果,输出结果缩略图。 图2 查看运行结果(1) 单击查看路径,查看输出结果详情。 可以单击左上角“下载”,下载当前的输出结果。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。
例列表。 --log -g 否 本地存放task日志的路径,必须与--task一起使用以获取作业某一task的日志。 --task -a 否 task名称。如果是并发的task,那么默认获取索引号为0的task实例,如果要查看别的实例,格式: --task task名称;实例索引,如--task
查询应用 使用get命令查询应用的详细信息,该命令同时可用于获取应用模板。 命令结构 health get app ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 否 不选此参数时,列出当前所在项目的所有应用信息。 指定app-id或app-name:
查询镜像 使用health docker images命令查询项目中的镜像。 命令结构 health docker images [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 查询指定镜像名下的所有tag信息,支持模糊查找。 --type -t