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Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 项目 项目是EIHealth平台的一个工作空间,可以在项目中存储数据,上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引
compute-resources [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 --force -f 否 是否强制操作。 --labels -l 否 需要添加或删除的标签列表。json数组格式。如:-l "[\"h1\",\"h2\"]" --node -n 是 计算资源节点id --operation-type
Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 步骤1:新建fastqc镜像 在linux环境上配置docker环境。 curl -fsSL get.docker
Boolean 是否domain用户 create_time String 用户创建时间,UTC时间 pwd_status Boolean 是否需要修改密码 update_time String 更新时间,UTC时间 source String 来源,PLATFORM或者IAM 请求示例
# 子任务实际名称,取值范围[1,32],只能以大小写字母开头,由字母、数字、中划线(-)、下划线(_)组成,以大小写字母或数字结尾。需要和已有子任务的名称一致。 inputs: - name: input-dir
-s 否 获取应用模板,模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取应用详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索应用。
# gpu申请使用量,取值范围[0-16],仅支持整数,Snt9有特殊约束,申请数量需要是0,1,2,4,8。 # 对于应用,不填默认
上传数据前需要使用switch命令进入待操作的项目。 列举路径中的文件夹对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时,需要使用路径/文件名或路径\文件名格式,如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如()之类的,运行的时候需要将整个
然后使用新软件包。 参考信息 如何修复 “conda: command not found”? 当terminal第二次打开时,环境变量将被清理,因此我们需要再次初始化Anaconda配置。 export PATH=~/anaconda3/bin:$PATH source ~/.bashrc 父主题:
Boolean 是否domain用户 create_time String 用户创建时间,UTC时间 pwd_status Boolean 是否需要修改密码 update_time String 更新时间,UTC时间 source String 来源,PLATFORM或者IAM 请求示例
获取流程模板,模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取workflow详情时,将内容下载到的指定文件夹路径(文件夹需要存在)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索workflow
箱。 单击“重置手机号”后,可以选择清除手机号或绑定新手机号。 单击“重置密码”后,输入新密码和确认密码。用户密码重置成功后,首次登录成功需要再次修改密码。 父主题: 用户管理
&& ./configure --prefix=/usr/local/samtools && make && make install 按Esc键,并执行:wq保存并退出Dockerfile。 制作镜像。 docker build -t bwa_samtools:0.7.17-1.10
分段总数,上传的文件总共分成了几个片段 最小值:1 最大值:128 缺省值:1 multipart_id 否 String 分段上传任务id,除了第一个片段外,后续的片段都需要标识出任务id 最小长度:1 最大长度:128 file_name 否 String 文件名称 最小长度:1 最大长度:100 version
<destdir> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 srcdir 无 是 源路径。可以为已引用的数据,查看引用数据时,需要使用绝对路径。 destdir 无 是 目的路径。 --rename -e 否 重命名,下载文件时可选。 --recursive -r 否
分段总数,上传的文件总共分成了几个片段 缺省值:1 最小长度:1 最大长度:4 multipart_id 否 String 分段上传任务id,除了第一个片段外,后续的片段都需要标识出任务id 最小长度:1 最大长度:128 file_name 否 String 文件名称 最小长度:1 最大长度:2000 md5 否
图4 项目详细信息 项目状态 可用:项目当前状态正常。项目创建完成后进入“可用”状态,可用状态的项目允许被冻结、删除、转移和分享,执行此类操作需要该项目的成员拥有相关权限。 冻结:项目当前不可用。处于“冻结”状态的项目,用户无法进入该项目查看项目的开发环境、流程等历史运行情况。冻结的项目可以通过解冻操作重新激活。
String 用户名 status String 删除结果 failed_reason String 失败原因 请求示例 批量移除项目成员,指定需要移除的成员的用户id https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_
# gpu申请使用量,取值范围[0-16],仅支持整数,Snt9有特殊约束,申请数量需要是0,1,2,4,8。 # 对于应用,不填默认
排序字段,支持type和end_time,默认为end_time,获取归档列表时生效。 --data-list -d 否 获取指定归档的全部数据清单,需要与archive-id一起使用才生效。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。