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本节指导用户安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件,HPC-X 的下载需要参考弹性云服
在部署/创建集群过程中出现某个节点未加入集群或者不存在需要怎么办? 问题描述 在部署/创建集群过程中,如果出现某个节点未加入集群或节点不存在,那么集群将无法正常部署/创建。 处理方法 可删除集群重新创建,选择其中创建成功的计算节点手动绑定EIP,然后和其他计算节点重新创建集群。
ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id root@192.168.0.166 配置ssh第一次登录免输入yes 在~/.ssh/config文件中加入如下内容:
core_num2:指定每个主机运行的物理核数。 hiroce gids:查下设备名和index。 UCX_NET_DEVICES: hiroce gids查到的有ip值一行的ib_dev的值: port的值。 UCX_IB_GID_INDEX:hiroce gids查到的有ip值一行的idx的值。 2.
数的关键应用会采用IPoIB方式通信。 无修改:指运行在IP协议上的应用不需要作任何修改,即可适配IB网络运行。 IPoIB的通信模式有哪些 IPoIB设备能够配置为datagram和connected两种模式,前者提供不可靠的、无连接的链路,后者提供可靠的、有连接的链路。 在datagram模式下,queue
"HPC型"或"HPC缓存型"文件系统类型。 图2 选择文件系统类型 3.在"创建文件系统"界面的"选择网络"选项中,需注意与购买的弹性云服务器选择相同的网络配置。 4.在"创建文件系统"界面的其他选项中请您根据业务需要,按需填写即可,填写完成后点击购买,完成创建。 图3 完成创建
间环境切换的次数。 没有CPU参与:应用程序可以访问远程内存,而不占用远程机器中的任何CPU。远程存储器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。 基于消息的事务:数据被作为离散消息处理,而不是作为流,这消除了应用将流分成不同消息/事务的需要。
登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“共享存储”进入共享存储管理页面。 在“共享存储”页,在左上角选择集群。 单击页面右上方的“挂载”。 在挂载共享存储的页面,填写共享存储的挂载点,并在下拉列表中选择弹性文件服务名称。 单击“确定”,将弹性文件服务挂载至对应的集群。 卸载共享存储 登录HPC-S²控制台。
配置BMS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。
bashrc 验证MPI运行在RoCE网络上 执行以下命令,安装iproute2。 yum -y install iproute* 执行以下命令,查看RoCE上是否有流量。 rdma res show 若MPI运行中,回显结果中qp 数量较大(大于1),则证明运行在 RoCE 网络上: 无业务时
包周期节点需要手动退订。 多节点批量删除操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”; 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 可同时在节点列表左侧勾选多个要进行删除操作的节点,单击集群名称左侧的“删除”。 按需类型节点批量删除 选择是否删除云服务器资源,如勾选,
弹性云服务器(ECS) 用于在公有云平台上创建高性能计算服务器。 虚拟私有云(VPC) HPC场景下所涉及的云服务器,都位于同一个VPC中,并且需要使用VPC中的子网和安全组的相关网络安全隔离。 镜像服务(IMS) 在创建高性能计算的云服务器时,需要使用符合要求的镜像文件。 在制作私有镜像时,
stop 执行以下命令,用“IP:Number”的形式作为MPI集群运行程序时的hostlist参数,在集群上通过Spectrum MPI运行可执行文件。其中, IP代表集群中的弹性云服务器IP地址。 Number代表该弹性云服务器的任务数。 假设集群中共有两个弹性云服务器,主机名
为什么集群被删除后还在计费? 按需购买的集群删除时未勾选“删除云服务器”,因此只删除了集群信息,集群中的云服务器资源仍在继续扣费。 包周期类型的集群删除时只能删除集群信息,云服务器资源需要手动退订。 管理节点如使用购买EIP的选择,集群删除时,即使勾选了“删除云服务器”,绑定的EIP资源也不会删除
为什么集群被删除后还在计费? 在部署/创建集群过程中出现某个节点未加入集群或者不存在需要怎么办? 集群云服务器节点创建完成,但在部署过程中失败了能否修复? 集群创建任务提交失败,提示“Insufficient EIP quota”怎么办? 集群创建提交失败,提示集群配额不足怎么办? 集群的管理节点为
此时,pbs作业回到queued状态,等待可用的计算资源。 开机2中关闭的计算节点,提供可用的计算资源。 此时,pbs作业会继续进行。 作业执行完成后,执行以下命令,查看作业信息。 qstat -f 作业ID 如图5所示,作业运行了3分03秒。由此可以看出,作业是从断点的位置进行续算的。 图5 中断后运行作业信息
已确保Linux云服务器网卡设置为DHCP的方式动态获取网络地址。 已清理Linux云服务器中的udev配置规则。 已安装并配置Cloud-init工具。 已卸载Linux云服务器中挂载的所有数据盘。 控制台方式 登录管理控制台。 选择“计算 > 弹性云服务器”。 进入弹性云服务器信息页面。 在弹性云服务器列
E v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v2是一种Internet层协议,即可以实现路由功能。虽然RoCE协议这些好处都是基于融合以太网的特性,但是RoCE协议也可以使用在传统以太网网络或者非融合以太网络中。 应用场景 网络密集型应用,例
3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm 下载需要的HPC-X工具套件。 IBM MPI在EDR SR-IOV场景下的运行需要HPC-X提供的MXM库的支持,HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本,例如,下载的HPC-X版本为:hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4
计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求,如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等,缩短需要的大量计算时间,提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需租用,成本低,降低中小客户使用HPC的门槛。 提高效率 按需发放,快