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HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
集群的管理节点为运行状态,但是集群异常提示“master node cannot reached”怎么办? 问题描述 集群的管理节点为运行状态,但是集群异常提示“master node cannot reached”。 处理方法 检查“/etc/ssh/sshd_config”配
在HPC集群上运行Spectrum MPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行Spectrum MPI应用(IBM Spectrum MPI v10.1)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
在HPC集群上运行Intel MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群(以CentOS7.3为例)上运行Intel MPI应用(l_mpi_2018.0.128版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
在HPC集群上运行社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行社区MPI应用(3.1.1版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。
在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行IB驱动自带的MPI应用(3.0.0rc6版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使
启动节点 操作场景 节点关机后,如需再次重启恢复使用,可重新启动节点。 状态为“停止”的节点可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要启动的节点,单击操作中“更多 > 启动”。
在HPC集群上运行Platform MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群(以CentOS7.3为例)上运行Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。
停止节点 操作场景 按需付费类型的节点资源暂不使用或出现故障时可停止节点,使资源不再计费。 包周期资源关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 只有状态为“运行中”的节点可执行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。
社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
重启节点 操作场景 当集群中某节点出现异常,可以使用节点重启的功能对该节点进行重启操作尝试恢复。 只有状态为“运行中”的节点可进行重启操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“节点管理”。 在“节点管理”页面集群的下拉框切换到要进行节点操作的集群。 选择要进行停止操作的节点,单击操作中“更多
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IB驱动自带的OpenMPI(以版本3.0.0rc6为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本3.1.0rc2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 本节操作指导用户在BMS上安装和使用IB驱动自带的Open MPI(以版本4.0.2a1为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 该任务指导用户在鲲鹏BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(以版本4.0.2a1为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI(以4.0.2版本为例))。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
配置ECS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在ECS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。仅支持在使用密钥登录弹性云服务器的情况下配置ECS集群互相免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo
启动集群 操作场景 停止状态的集群,如需再次开启集群执行作业,可将集群重新启动。 只有状态为“停止”的集群可进行启动操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要启动的集群,单击后方操作列“更多 > 启动”。 单击“确定”。 在集群
停止集群 操作场景 按需类型的集群,如暂时没有任务需要执行,可使用集群停止功能对集群进行管理操作以节省费用。 包周期资源不适用,关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 有集群状态为“运行中”的集群可进行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。
安装和使用Platform MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。