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裸金属服务器场景支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(X86
0rc6/lib64 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 # source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2 查看MPI环境变量 系统回显结果如图2所示,则环境配置正常。 执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel
MANPATH=$MPI_ROOT/share/man:$MANPATH unset MPI_REMSH 执行以下命令,查看环境变量导入是否成功。 # which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 执行以下命令,编辑文件。
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI(X86 BMS场景) 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
bashrc 验证MPI运行在RoCE网络上 执行以下命令,安装iproute2。 yum -y install iproute* 执行以下命令,查看RoCE上是否有流量。 rdma res show 若MPI运行中,回显结果中qp 数量较大(大于1),则证明运行在 RoCE 网络上: 无业务时
ssh $ mv *.pem id_rsa 执行以下命令,给密钥文件配置权限。 $ sudo chmod 600 id_rsa 执行以下命令,查询主机名。 # hostname 执行以下命令,添加本主机私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 示例: 192.168.0
-F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $
-F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $
-F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $
-F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $
LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich-332/lib 执行下列命令,导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。
已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。 $ ls /usr/mpi/gcc/openmpi-4.0.2a1/bin/mpirun $ rpm -qa | grep mlnx-ofa 图1 检查IB驱动 查看回显结果。 如果回显如图
集群创建完成后,如需查看集群所使用的共享存储的详细信息,可进入一站式HPC服务提供的“共享存储”页,查看例如集群所使用的SFS的名称和ID、存储协议、共享路径以及挂载点等信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“共享存储”。 在“共享存储”页,查看集群对应的共享存储的详细信息。
# cat /sys/class/infiniband/mlx5_0/ports/1/pkeys/* | grep -v 0000 图2 查询pkey值 普通用户下,在~/.bashrc中添加如下语句: export MPI_ROOT=/opt/ibm/platform_mpi export
执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # systemctl status firewalld.service 图1 关闭防火墙成功 依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤1.1~步骤1.3,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。
执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # systemctl status firewalld.service 图1 成功关闭防火墙 依次登录集群中所有ECS,重复执行1.a~1.c,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。
已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。 $ ls /usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin/mpirun $ rpm -qa | grep mlnx-ofa 图1 确认已安装IB驱动 查看回显结果。 如果回
且后面starccm使用platform方式启动时候需要使用该配置名称。 enp177s0为网卡名称,可以使用ip a或者ipconfig查看到。 验证Udapl(使用dtest测试RoCE网络) 使用 dtest 进行验证: server端(192.168.0.96):dtest