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PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。
PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为项目路径,为公共数据场景时为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,仅支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。
时,可以使用自己制作的Notebook镜像。镜像制作方法请参见镜像管理。制作Notebook自定义镜像时,需要依赖平台提供的基础镜像,获取地址请参见获取镜像。 CPU 设置CPU大小。 取值范围:1~128,默认为1。 GPU 设置GPU大小。 取值范围:0~16,默认为0。 内存
单击页面右上角“复制”。 图1 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹,以及数据存储路径,单击“确认”,复制数据。 例如,将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。 图2 复制数据 下载数据 下载数据操作会产生流量费用,计费方式为按需计费,计费详情请参考OBS数据下载费用。
PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。
能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1.连接容器镜像服务操作,然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。 # 基础镜像 docker pull swr.cn-north-4.myhuaweicloud.com/eihealth-
"archive_days": 20, "size": 14144732346, "description": "", "operator_name": "ei_eihealth_02", "storage_type":
参数类型 描述 name String 报告文件名 最小长度:1 最大长度:1024 download_url String 报告文件下载地址 最小长度:1 最大长度:1024 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "report_files" : [ {
create_time String 镜像版本创建时间 update_time String 镜像版本更新时间 path String 镜像地址 请求示例 查询镜像版本列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对等步骤,输出针对fastq的qc报告,输出STAR比对得到的bam文件。 MetaGenome Kraken2 pipeline 宏基因组 ( Metagenome)(也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome,或元基因组)是由
模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object 区间上下限,仅回归型存在。 description String 模型描述信息。 表7 ValueRange 参数 参数类型 描述 lower Float 区间下限,仅回归型存在。
文件夹中。 单击“复制”。 图2 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹,以及数据存储路径,单击“确认”,复制数据。 例如,将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。 图3 复制数据 解除引用 将已经引用的数据解除引用关系。有以下两种方式,可以实现解除数据的引用。
使用URL方式将公网http/https/ftp链接的数据或者OBS中的数据导入。 单击数据中心右上角“URL导入”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用URL导入 父主题: 数据管理
PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为用户私有数据中心为项目路径,为公共数据场景时为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,支持SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6
拷贝其他项目中的文件,将project1项目中的zip文件拷贝至本项目src1中。拷贝其他项目文件,需要是该项目的成员,并具备数据操作权限,详细权限介绍请参见项目成员和权限。 health cp project1:/test/test.zip /src1/ -r -f 父主题: 数据管理命令
使用URL方式将公网http/https/ftp链接的数据或者OBS中的数据导入。 单击“添加数据”,类型选择“URL”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用url导入数据 父主题: 数据管理
yaml文件填写规则,完整的NGS配置文件请参考本示例以及获取NGS作业配置文件章节得到的作业信息和模板填写。 job: name: ngs-test description '' priority: 0 timeout: 1440 output_dir: '' workflow_id:
文件来源,支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度:1 最大长度:8 url 否 String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。
Product-likeness score,天然产物的相似度评分。 结果解释:最佳在-5~5之间,分数越高代表越接近天然产物。 Lipinski Rule: Lipinski规则,MW≤500;logP≤5; nHA≤10; nHD≤5。 结果解释:超过2个及以上不满足以上规则,代表吸收和渗透性较差。
创建自动作业 针对存在需要批量创建分析作业的场景,您可以选择创建自动作业。 在“自动作业”页签,您可以查看已创建的自动作业,包含作业名称、状态、数据表、创建者、创建时间;在操作列,您可以对已创建的自动作业执行启动、编辑、删除操作,运行中的作业可以执行停止操作。 图1 自动作业 前提条件