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过程。 health create backup h-test2 --path lmx-test-data/ -s COLD --description test # 返回结果如下 create archive h-test2 successfully! Linux和macOS
String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选
工具管理 工具管理简介 新建应用 导入应用 上传应用 发布应用 编辑应用 创建FastQC应用样例 新建流程 流程设计器 导入流程 上传流程 发布流程 添加分类标签 下载应用或流程 父主题: 用户指南(基因平台)
cli-demo-job cp-test 2.0.0 workflow PENDING wwx-test-admin 2024-01-05 14:18:51 --
删除项目 使用delete命令删除项目。项目的所有者有权限执行该操作。 为了防止项目误删,执行项目删除命令后工具会提示用户进行二次确认输入要删除的项目,只有二次输入的项目名称和命令中的项目名称一致,命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project
--update -r 使用引用方式下载。 引用了bucket-test项目,下载引用项目根目录的test1.txt文件至本地的src1文件夹中,命令如下: health download bucket-test:/test1.txt /src1 父主题: 数据管理命令
tag demo-image:v1.0 project-demo-image:v1.0 若当前所在项目为lmx-test-01,执行如上命令后,本地镜像列表会新增lmx-test-01/project-demo-image:v1.0。 若当前不在某个项目内,会提示: Error: you're
将本地D:\local\data\test.txt路径下的txt文件上传至EIHealth平台项目中的src文件夹中。 上传完成后,会在EIHealth平台数据管理页面的src文件中,生成test.txt文件。 health upload D:\local\data\test.txt /src/
如何将生物信息学软件封装为镜像并上传? 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例,帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检查工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成
全路径(含从根路径开始的对象前缀和对象名,例如,桶内对象路径为obs://bucket/src1/src2/test.txt,则对象的全路径为src1/src2/test.txt)。该匹配模式仅适用于对象名非“/”结尾的对象。 支持指定多个exclude参数,如--exclude
获取项目ID 从控制台获取项目ID 在调用接口的时候,部分URL中需要填入项目编号,所以需要获取到项目编号。项目编号获取步骤如下: 登录管理控制台。 单击用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 在“API凭证”页面的项目列表中查看项目ID。 图1 查看项目ID 调用API获取项目ID
息体。 状态码 状态码是一组从1xx到5xx的数字代码,状态码表示了请求响应的状态,完整的状态码列表请参见状态码。 对于获取用户Token接口,如果调用后返回状态码为“201”,则表示请求成功。 响应消息头 对应请求消息头,响应同样也有消息头,如“Content-type”。 表1
资产市场简介 资产市场是在EIHealth平台的基础上构建的开发者生态社区,提供镜像、数据、应用和流程的内容共享。提供安全、开放的资产共享和使用,加速基因、药物、临床应用的开发与落地,保障开发生态链上各参与方高效地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、
使用AutoGenome镜像 AutoGenome是Notebook镜像,利用AutoML等技术帮助科研工作者在基因组学数据上端到端实现深度学习网络搜索,训练,评估,预测和解释的工具包。 使用AutoGenome镜像的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅镜像 步骤2:创建Notebook
该匹配模式作用于对象全路径(含从根路径开始的对象前缀和对象名,例如,桶内对象路径为obs://bucket/src1/src2/test.txt,则对象的全路径为src1/src2/test.txt)。该匹配模式仅适用于对象名非“/”结尾的对象。 支持指定多个exclude参数,如 --exclude
方式2:使用预置应用搭建NGS流程 将EIHealth平台预置的应用构建成流程,并运行作业。以二代基因组分析流程:fastp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize两个算法为例。 应用是对每个软件的镜像封装,将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用,不用担心复杂的开发环境问题。
量化评估速度的数十倍。 病灶区域分割DICE(预测病灶和真实病灶的重合度)及AVD(预测病灶体积与真实病灶体积误差)指标业界领先,与医生用手工精准勾勒的结果高度一致。 图2 影像分析图 新冠肺炎药物筛选 为了全面、系统地评估药物对新冠病毒所有靶点蛋白的结合情况,华为云联合多家科研
邮箱连通性测试 功能介绍 邮箱连通性测试 URI POST /v1/{project_id}/messages/email-connection-test 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
自定义镜像创建Notebook样例 Notebook提供了在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码,在创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像。同时,您也可以使用自定义镜像,创建Notebook,满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Noteboo
步骤3:初始化配置 在使用命令行工具前,需要初始化配置信息,通过config命令对eihealth-toolkit进行初始化配置。本节以Windows为例介绍配置过程,Linux和macOS环境配置过程相同。 命令结构 执行health config add命令进行初始化配置。 health