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用户权限所示。 表2 用户权限 用户角色 权限说明 管理员 拥有平台所有的权限,并进行用户管理,在平台添加子用户,以及对资源管理权限,包含有存储计算资源的购买和删除,自动扩缩容的策略配置权限。 操作员 拥有除用户管理、系统设置、设置商标、购买系统资源之外的所有权限。 购买平台的账户为管理员账户,该账户不可被删除。
pdbqt:将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf:将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt:将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w:分子对接。
nfig 响应示例 状态码: 200 OK { "scope" : "all", "resource_types" : [ "system" ], "language" : "zh_cn" } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: 消息中心管理
成公开的。 COPY 将本地的文件或目录复制到镜像中。 ADD 向新镜像中添加文件,这个文件可以是主机文件、网络文件或文件夹。 第一个参数:源文件(夹)。 如果是相对路径,必须是相对于Dockerfile所在目录的相对路径。 如果是URL,会将文件先下载下来,然后再添加到镜像里。
针对构建Index后的bam文件,统计测序数据的Insert size的分布。 picard-insertsize:2.23.3 docker pull broadinstitute/picard:2.23.3 Bam QC 评估比对得到的bam文件的质量。 qualimap-bamqc:2
-e 否 常用的三种分隔符为(;,\t),也可以根据导入数据的文件格式设定其他分隔符。 --files -f 否 生成实例数据的文件列表,多个文件用分号(;)分隔。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eih
Project Name Status Operator Operated lmx-project-01 system PROJECT_DELETE xxx SUCCEED lmx-test-01 2021-02-01
在“数据中心”页面,使用“复制”,将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击页面右上角“复制”。 图1 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹,以及数据存储路径,单击“确认”,复制数据。 例如,将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。 图2 复制数据
缺省值:max metric_name 是 String 查询的监控指标名称 resource_id 否 String 查询的监控资源对象id,当查询存储资源和计算节点资源中的集群监控数据时,不需要填写资源id 最小长度:1 最大长度:128 device_id 否 String 显卡id,
作业执行超时时长,取值范围: [1, 144000],单位:分钟,默认数值1440 最小值:1 最大值:144000 output_dir 否 String 作业结果存储目录,不指定则在workflow的工作目录下生产job同名子目录,指定则已指定路径为准;输出路径必须以斜杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾
String 项目名称 creator String 项目所有者 role String 当前用户在该项目上的角色 size Long 项目桶存储量 status String 项目状态 tags Array of strings 标签列表 description String 项目描述
src-dir 无 是 源路径,支持四种格式,分别是医疗项目、外部桶、外部并行文件系统或者网络数据下载链接,对应格式分别为ProjectName:/path、OBS:BucketName:/path、OBSFS:ObsfsName:/path、下载url。 须知: 源路径中如果要填写多个路
"receptor_file" : { "source" : "EXTRANET", "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb" } } 响应示例 状态码: 200 受体口袋检测成功响应。 { "mode"
数据管理命令 列举对象 显示当前目录 切换路径 文件拷贝 创建子目录 上传数据 清理本地记录的上传文件 下载数据 删除数据 数据导入 创建归档 获取归档数据 删除归档 恢复归档 获取数据归档列表 修改归档区域 获取数据作业 删除数据作业 重试数据作业 取消数据作业 移动对象 增量同步
及《隐私政策声明》约束。 下载地址中带有sha256后缀的链接,指的是对应软件包的校验文件。例如:Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64 ,它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。 详细的
参数类型 描述 id String id name String 归档名称 type String 类型 storage_type String 存储类型 region String 区域 paths Array of strings 归档数据路径集 start_time String 归档开始时间
在配置页面,进行分子搜索配置,包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面 输入小分子:可以通过输入SMILES、上传文件或者直接绘制输入小分子。最终以SMILES为准。 选择算法:可以选择ECFP4 Tanimoto相似度或者骨架搜索。ECFP4 Tanim
支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。 支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合,将不同结构叠合在一起,用于比较结构差异。 输出指定蛋白口袋的位置及大小,用于分子对接。 导出不同分辨率的图片文件。 播放与制作分子动力学轨迹动画。
rug-common/receptor/info { "source" : "RAW", "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb", "format" : "PDB", "data" : "MODEL1
"gpu_type" : "GPU", "gpu" : "0" }, "io_acc_type" : "SFS" } ] } 响应示例 无 状态码 状态码 描述 202 ACCEPTED 错误码 请参见错误码。 父主题: 作业管理