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获取资源监控数据 - 医疗智能体 EIHealth
String 查询的监控指标名称 resource_id 否 String 查询的监控资源对象id,当查询存储资源和计算节点资源中的集群监控数据时,不需要填写资源id 最小长度:1 最大长度:128 device_id 否 String 显卡id,仅查询裸金属节点的gpu监控时,需要指定
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资源监控数据获取 - 医疗智能体 EIHealth
资源监控数据获取 获取资源监控数据 批量获取资源统计数据 父主题: 系统管理
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资源看板 - 医疗智能体 EIHealth
资源看板 在“资源看板”中,您可以实时监控计算资源、存储资源、性能加速、数据库的使用情况。 图1 资源看板 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
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批量获取资源统计数据 - 医疗智能体 EIHealth
String 数据单位 metric_name String 监控指标名称 resource_id String 监控资源id device_id String 显卡id 请求示例 批量下载监控数据,设置起止时间,实时数据,统计方式为max, 指定资源id列表 https://eihealth
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个人设置 - 医疗智能体 EIHealth
个人设置 在平台右上角用户名中选择“个人设置”,可以修改邮箱、手机号和密码。最终租户仅可修改邮箱和手机号,子用户可以修改可以修改邮箱、手机号和密码。 图1 修改个人信息 父主题: 系统设置
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获取子任务中实例的资源监控数据 - 医疗智能体 EIHealth
获取子任务中实例的资源监控数据 功能介绍 获取子任务中实例的资源监控数据 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/tasks/{task_name}/instan
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安全设置 - 医疗智能体 EIHealth
行操作。平台的任一用户均可对自己的邮箱、手机号码和密码进行修改。 在平台右上角用户名中选择“个人设置”,在“安全设置”中修改账号的安全信息。 图1 安全设置 如果创建平台用户时,未填写邮箱或手机号,则在进行安全设置时,会提示设置邮箱或手机号。 如果是最终租户,不支持修改密码。 父主题:
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修改用户基本信息 - 医疗智能体 EIHealth
参数类型 描述 mobile 否 String 用户手机号,纯数字,长度小于等于32位,当且仅当重置手机号时传入空串。必须与国家码同时存在。 最小长度:0 最大长度:32 areacode 否 String 国家码,当且仅当重置手机号时传入空串。中国大陆为“0086” 最小长度:0
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如何将生物信息学软件封装为镜像并上传? - 医疗智能体 EIHealth
如何将生物信息学软件封装为镜像并上传? 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例,帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检控工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成
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购买系统资源 - 医疗智能体 EIHealth
选择“平均值”,则选择所有取值的平均值。 查看计算资源节点监控 您可以在计算资源页面,单击节点“监控”列后面的图标,直接查看资源节点的监控信息。上箭头是最大值,下箭头是最小值,虚线右边的数据是平均值。 图21 查看节点监控信息 父主题: 准备工作
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创建子用户 - 医疗智能体 EIHealth
“密码”。 “角色”分为管理员和操作员。权限区别请参见表 用户权限。 图2 必填信息 选填信息。选填信息包括“邮箱”、“国际电话区号”、“手机号码”、“用户资源配额”。 图3 选填信息 单击“确认”,完成子用户创建。 父主题: 用户管理
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镜像管理简介 - 医疗智能体 EIHealth
镜像管理简介 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台
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关键概念 - 医疗智能体 EIHealth
关键概念 镜像 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平
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如何搭建Docker环境? - 医疗智能体 EIHealth
快照方式制作镜像(偶尔制作的镜像):在基础镜像上,比如Ubuntu,先登录镜像系统并安装Docker软件,然后整体制作快照,即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像(经常更新的镜像):将软件安装的流程写成DockerFile,使用Docker build构建成Docker镜像。
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方式3:自定义镜像运行FastQC流程 - 医疗智能体 EIHealth
本示例中制作FastQC镜像,并基于镜像创建应用,运行分析作业。 镜像简介 由于生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。 将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,
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制作Docker镜像 - 医疗智能体 EIHealth
快照方式制作镜像(偶尔制作的镜像):在基础镜像上,比如Ubuntu,先登录镜像系统并安装Docker软件,然后整体制作快照,即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像(经常更新的镜像):将软件安装的流程写成DockerFile,使用Docker build构建成Docker镜像。
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用户管理介绍 - 医疗智能体 EIHealth
用户名中选择“用户管理”,在“操作”列中选择“安全设置”,重置其他用户的邮箱、手机和密码信息。 单击“重置邮箱”后,可以选择清除邮箱或绑定新邮箱。 单击“重置手机号”后,可以选择清除手机号或绑定新手机号。 单击“重置密码”后,输入新密码和确认密码。用户密码重置成功后,首次登录成功需要再次修改密码。
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最终租户修改子用户 - 医疗智能体 EIHealth
最大长度:32 mobile 否 String 用户手机号,纯数字,长度小于等于32位,当且仅当重置手机号时传入空串。必须与国家码同时存在。 最小长度:0 最大长度:32 areacode 否 String 国家码,当且仅当重置手机号时传入空串。中国大陆为“0086” 最小长度:0
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管理用户 - 医疗智能体 EIHealth
移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号以及系统管理员权限的更改。在用户操作列,单击“编辑”,重置用户的相关信息。 最终租户可以编辑子用户角色、手机号、邮箱。 系统管理员只能编辑角色,非系统管理员无编辑权限。 图3 重置用户信息 重置密码
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应用的参数和镜像启动命令如何设置? - 医疗智能体 EIHealth
创建应用时,需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如,设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时,首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照FastQC的调用命令设置参数和镜像启动命令。 图1 FastQC命令