检测到您已登录华为云国际站账号,为了您更好的体验,建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
\ && apt-get install -y default-jre perl wget zip # 下载FastQC,解压缩,设置FastQC可执行权限 RUN wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0
点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无
点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无
选择的属性包含在我们所设置的参数设置区间内。“最大化”指的是我们所设置的属性越大越好,而不只是限定在某区间内,当我们无法判断属性应该设置在什么区间,但是属性越高,成药性越好,可以设置属性设置条件为最大化,这个只能在弱约束里面进行设置。“最小化”指的是所设置的属性越小越好,与最大化相反,也是只能在弱约束里面进行设置。
json -with-trace -with-report -with-timeline -with-dag -with-weblog 'http://127.0.0.1:8445/v1.0/nextflow/web-log'", "Mar-07 15:48:05
选择的属性包含在我们所设置的参数设置区间内。“最大化”指的是我们所设置的属性越大越好,而不只是限定在某区间内,当我们无法判断属性应该设置在什么区间,但是属性越高,成药性越好,可以设置属性设置条件为最大化,这个只能在弱约束里面进行设置。“最小化”指的是所设置的属性越小越好,与最大化相反,也是只能在弱约束里面进行设置。
联系管理员。 节点数上限 设置自动扩容的节点数上限。 取值范围为0-50。 节点数下限 设置自动扩容的节点数下限。 取值范围为0-50。 CPU执行规则 设置CPU自动扩容的条件。 启用规则:默认开启。 触发条件:设置CPU分配率达到的条件,当满足设置的条件时进行自动扩容。取值范围:1-100。默认值:80。
单击“确认”,转移项目。 设置项目存储容量 平台支持项目管理员以上角色,配置项目的最大存储量。 单击项目名称,在项目页面选择“设置”。 在项目详情页面,单击“已用存储量”后面的。 图6 设置存储容量 开启容量限制开关后,设置最大存储量。 图7 容量限制 设置成功后,单击“确定”。
fastp-file2。 图8 设置fastp输入数据 将GRCh38目录指定成bwa-mem与picard-insertsize的输入。 图9 设置bwa-mem输入数据 图10 设置picard-insertsize输入数据 若是想查看已经设置好的参数,可以按照下图步骤进行查
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题: 系统管理
强制操作,不进行询问提示,上传文件夹时可选。 --flat -l 否 上传文件夹时,只上传该文件夹下的所有内容,上传文件夹时可选。 --update -u 否 增量上传操作,设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件,仅在以下情况时上传数据: 文件不存在。 待上传文件大小不与平台文件大小一致。 文件的最后修改时间不一致。
输入已添加至平台的用户的全称。 图5 输入用户名全称 单击“添加”,设置用户角色。详细成员角色介绍请参见表1。 图6 设置成员角色 单击“确认”,将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 操作步骤 单击项目名称,进入项目“设置”页。 单击“操作”列“修改”,重新设置项目成员的角色。 详细项目成员角色和权限介绍请参见成员角色和权限。
获取地址请参见获取镜像。 CPU 设置CPU大小。 取值范围:1~128,默认为1。 GPU 设置GPU大小。 取值范围:0~16,默认为0。 内存 设置内存大小。 取值范围:2~512,默认为2。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OB
系统配置和供应商配置 查询系统配置列表 获取供应商配置 设置供应商配置 获取跨域归档配置 修改跨域归档设置 父主题: 系统管理
对于输入参数,打开“并发”开关,在启动作业时,每个参数可以设置多个参数值,自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如,存在输入参数a和输入参数b,在启动作业时,分别给参数a设置了2个参数值,给参数b设置了2个参数值。那么,系统将自动生成4个作业并发执行。
--crr -c 否 复制时使用客户端跨区域复制模式,从通过数据流的方式从源桶直接复制数据到目标桶,且两个桶可以是任意两个OBS服务的桶。 若设置了该参数,必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息,具体可参考更新配置文件。复制时源桶对应的配置信息为配置文件中的:akCr
数据导入 创建归档 获取归档数据 删除归档 恢复归档 获取数据归档列表 修改归档区域 获取数据作业 删除数据作业 重试数据作业 取消数据作业 移动对象 增量同步 删除分段上传任务 修改权限 查看对象属性
导入网上数据 引用项目数据 订阅资产市场数据 上传数据文件 批量删除项目数据 获取桶列表 查询项目级数据权限控制策略 设置项目级权限控制策略 获取数据详情 设置数据对象策略 发布数据资产 父主题: 数据管理
下载数据 禁止/允许删除数据 您可以对某个数据设置禁止删除。设置禁止删除后,该目录只能添加数据,不支持删除数据。也可以通过“允许删除”取消禁止删除设置。 图7 开启禁止删除数据 支持设置最多15个数据的禁止删除状态。 如果平台或者父目录设置禁止删除状态,则对应的数据根路径或者子路径均
IO加速实例id,为空则不开启IO加速,设置相应加速包id将会开启加速。实例id可参考“系统设置命令>获取系统资源”章节获取。当id设置为:auto_schedule,则会自动调度加速包,当id设置为local_disk,则开启本地盘加速。 --nodeLabels -l 否 用于让作业调度到设置了该标签的节