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全可靠的镜像管理。单击项目名称,进入所选项目,在“镜像”页签中,以列表形式展示了项目中的镜像。您可查看镜像的详细信息,执行镜像分类、添加描述、删除和查询操作。 图1 镜像管理 镜像用途 用于创建分析应用 应用是生物信息学软件的镜像封装。例如,您可将Cell Ranger软件封装为
请求示例 订阅应用,订阅后应用名称为dest_app_name,应用版本为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/subscribe
过“导入应用”的方法,导入至自己的项目中使用。 流程 EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。 分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。
ImportAppRsp 参数 参数类型 描述 source_app_id String 源应用id destination_app_id String 目标应用id destination_app_name String 目标应用名称 version String 应用版本 message
并开通华为云时提供的用户名等信息,用于登录并操作EIHealth平台的项目、数据等资产。这些信息的处理将遵循您已接收的《华为云用户协议》及《隐私政策声明》约束。 下载地址中带有sha256后缀的链接,指的是对应软件包的校验文件。例如:Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64
并开通华为云时提供的用户名等信息,用于登录并操作EIHealth平台的项目、数据等资产。这些信息的处理将遵循您已接收的《华为云用户协议》及《隐私政策声明》约束。 下载地址中带有sha256后缀的链接,指的是对应软件包的校验文件。例如:Windows x64版本的下载链接是health-windows-x86_64
查询IAM用户组的用户列表 功能介绍 查询IAM用户组的用户列表 URI GET /v1/{project_id}/iam/groups/{group_id}/users 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
在API栏选择需要使用的服务,单击操作列的“开通服务”。 服务开通成功后,开通状态为“已开通”。 “开通服务”按钮置灰,说明您尚未认证,请先实名认证。 开通医学影像API 进入EIHealth控制台,在页面左上角切换区域“华南-广州”。 在API栏选择需要使用的服务,单击操作列的“开通服务”。
src_project_name在使用导入or订阅的资源是需要填写,为空表示本项目 # 2. 其他场景,app_id为系统分配的唯一标识 app_id: xxx # 必选 app唯一标识 name:
tes、gatk-bqsr、gatk-applybqsr、gatk-haplotypecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。在创建应用前,请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息
描述 apps Array of AppListDto objects 应用列表 count Integer 应用总条数 表5 AppListDto 参数 参数类型 描述 id String 应用id name String 应用名称 version String 应用版本 summary
更改分析存储介质,例如使用更高性能的IO加速方案(SFS Turbo、EVS),如使用SFS Turbo加速,在投递作业时可以选择“IO加速”。 降低通量运行,进而降低带宽、IO需求,使得带宽、IO满足生产需求。 优化软件算法,如使用内存做缓存等,降低软件的IO需求。 针对特定的项目,对带宽或IO性能进行扩容。
表形式展示了项目中的应用。您可以新建应用、导入应用或上传应用,并查看应用详情、版本、创建者、修改和创建时间,可以对名称、创建者、修改时间、创建时间、源项目进行排序。并可执行查询、修改和删除应用的操作。 图1 应用列表 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定
"app_info": { "app_id": "2", "app_name": "zx-1030-mkdir", "app_version": "1.0.0", "app_src_project_name": "", "app_labels":
String 应用镜像 app_commands Array of strings 任务使用到的应用自带的命令信息 app_input_parameters Array of AppInputParameterDto objects 任务使用到的应用自带的输入参数信息 app_output_parameters
上传应用 通过在本地修改应用的yaml模板,上传应用至项目中。 获取应用yaml模板。 单击“上传应用”,在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具,执行health get app -s命令获取创建应用的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.tx
Token的有效期为24小时,需要使用同一个Token鉴权时,可以缓存起来,避免频繁调用。 Token在计算机系统中代表令牌(临时)的意思,拥有Token就代表拥有某种权限。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限。 u
Content-Type 用于指明发送给接收者的实体正文的媒体类型。 类型:字符串。 默认值:application/json; charset=UTF-8 是 对于获取用户Token接口,返回如图1所示。 其中“x-subject-token”就是需要获取的用户Token。有了Token之后
安装容器引擎 容器引擎是一个开源的引擎,可以轻松的为任何应用创建一个轻量级的、可移植的、自给自足的容器。 容器引擎几乎支持在所有操作系统上安装,用户可以根据需要选择要安装的容器引擎版本。请使用自己的电脑搭建Docker环境,或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 例如
如何调用API 开通服务 构造请求 认证鉴权 返回结果