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步骤4:查看与执行操作命令 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。配置信息导入后,即可查询命令行工具支持的操作,并执行相关命令,使用EIHealth平台。 详细的操作命令请参见其他章节。 查询操作命令列表。
最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String
查询分子合成路径规划作业详情 功能介绍 查询分子合成路径规划作业详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/synthesis/{job_id} 表1 路径参数 参数
查询自由能微扰作业详情 功能介绍 查询自由能微扰作业详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述
查询IAM用户组列表 功能介绍 查询IAM用户组列表 URI GET /v1/{project_id}/iam/groups 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
查询项目级数据权限控制策略 功能介绍 查询项目级数据权限控制策略 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/eihea
查询系统配置列表 功能介绍 获取系统配置列表 URI GET /v1/{project_id}/system/configs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
参数确认无误后,单击页面上方“启动作业”按钮,可以直接基于该流程创建自动分析作业。 查看作业运行结果 自动作业运行完成后,在自动作业列表中单击数据表名称,跳转至对应的数据表中。在设置的状态更新列中,单击执行结果跳转至对应的分析作业,查看作业运行结果详情。 图7 查看作业运行结果 父主题: 作业管理
查询IAM用户组的用户列表 功能介绍 查询IAM用户组的用户列表 URI GET /v1/{project_id}/iam/groups/{group_id}/users 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
应操作。 图5 编辑应用 单击按钮,进入参数设置页面,可查看修改参数。 名称:应用的原始名称。 版本:应用版本。 显示名称:应用在流程中的显示名称,可修改。 镜像启动命令:镜像启动的命令。可在右上角放大查看,在右下角下拉查看。 源项目:显示应用隶属的项目。 输入参数:由用户在创建应用时定义。
理员”。 配置完成后,单击“确定”。 等待导入成功后,单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用户,不支持删除,只支持移除,移除后不影响该用户操作其他服务。 图2 查看导入用户 医疗平台用户会在IAM中赋予以下细粒度权限,若该用户加入的其他IAM用户组有对
ockerhub官网进行查询。 查看镜像是否pull成功。 用docker images命令查看镜像是否pull成功。如果您本地已经有很多镜像,防止查询出全部镜像,可在docker images命令后面添加 | grep pegi3s使查询更精准。 查询fastqc软件命令。非常熟悉fastqc软件则可跳过此步骤。
查询bms计算资源显卡id列表 功能介绍 查询bms计算资源显卡id列表 URI GET /v1/{project_id}/system/computing-resources/{id}/devices 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String
在“项目列表”中,展示了当前用户有权限访问的项目。 图1 项目列表 查看项目信息 项目信息中提供了项目设置,成员管理,数据审计,您可以通过如下方式查看。 在平台左上角选择项目名称,单击,进入项目设置页面。 图2 查看项目信息 项目设置 在项目设置页面,可以查看项目名称,该项目的数据存储OBS桶名称。所有
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
源配额。 配置完成后,单击“确定”。 等待导入成功后,单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用户,不支持删除,只支持移除,移除后不影响该用户操作其他服务。 图3 查看导入用户 医疗平台用户会在IAM中赋予以下细粒度权限,若该用户加入的其他IAM用户组有对
医疗智能体平台提供了REST(Representational State Transfer)风格API,支持您通过HTTPS请求调用。 调用方法请参见如何调用API。 父主题: 使用前必读
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
-toolkit。数据上传可参考上传数据。。 数据上传成功后可以在数据详情页面查询,创建Nextflow流程时可以通过设置参数指定对应数据。 镜像上传可参考上传镜像。镜像上传成功后可以在镜像详情页面查询,复制其镜像地址填入Nextflow脚本中的container字段即可。 process
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128