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代码Cell 代码单元格。每一个Cell有两种模式：命令模式和编辑模式。 最左侧为蓝色条时，是命令模式，绿色条表示编辑模式（此时Cell中有光标，可以进行代码编写）。在命令模式下，按下“Enter”键或者鼠标单击代码框可以进入编辑模式。在编辑模式下，按下“ESC”键或者鼠标单击代码框左侧区域即可进入命令模式。
项目简介 项目是盘古辅助制药平台的一个工作空间，可以在项目中存储数据和创建作业。也可以将团队成员引入到项目中，并通过设置成员角色实现项目权限的划分。 您可以创建项目，并向其中上传数据、创建作业。 在“项目列表”中，展示了当前用户有权限访问的项目。 图1 项目列表 查看项目信息 项
在配置页面上传靶点结构，及配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构：选择靶点结构文件，仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体，则默认只处理第一个。 设计方式：支持“从头生成”和“片段优化”两种方式。 从头生成：通过指定的口袋生成小分子。 可以直接指定口袋，指定口袋的方式包括原始配体、选择残基、自动预测、自定义。
对项目执行冻结、解冻、转移、分享和删除操作时，需要项目成员具备相应的权限，不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结：冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止，此时可以将项目暂时冻结，待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目，用户无法进入该项目查看项目的开发环境
添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 存在一个创建好的项目。 单击项目名称后面，进入项目设置页。 选择“成员管理”，单击“添加成员”。 图1 添加成员 选择已添加至平台的成员名称及权限。
单击“靶点优化”功能卡片，进入配置页面。 配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件，文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体，默认只处理第一个。 靶点预处理： 去配体：提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷：是否加入离子，使体系电荷守恒，默认是平衡电荷。 蛋白力场：蛋白质力场支持amber03
添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 存在一个创建好的项目。 操作步骤 添加项目成员有两种不同的方法，请任选其中一种方法操作。 方法一 单击项目名称，进入项目“设置”页。 单击“添加”，添加成员。
None 医学文本标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行数据管理和标注 07:08 医学文本管理和标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行团队标注 05:44 医学文本团队标注 药物虚拟筛选 医疗智能体 EIHealth 药物虚拟筛选
biocontainers/fastp:v0.20.1_cv1 Mapping and Sort and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 bwa-mem:0.7.17 该镜像由bwa和samtool合并而成，镜像制作方法请参见制作bwa-mem镜像。 Insert Size
IHealth平台并生成数据库。同时，除了自定义数据库外，支持将作业运行中产生的数据文件创建为数据库。 创建数据库时，数据库模板为您提供了一个数据表的搭建框架，可通过数据库模板灵活的定义数据结构，描述数据及其关系。数据库以项目为粒度进行资源的隔离和访问控制，不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限。
GitHub获取：可以选择版本，目前支持选择的安装包版本v22.10.6，v22.10.0，v22.04.0。 上传安装包：用户直接上传一个Nextflow的安装包。如果选择此方式，您可以单击“点击此处”进入nextflow release进行下载安装包。 图2 选择安装方式 单击“开始安装”。
时长；如果选择的“按需”计费，无需选择购买时长。 勾选自动续费后，系统将在产品到期前自动续费，无需用户再手动操作。按月购买，自动续费周期为一个月。 单击“下一步”，确认订单详情。 单击“立即购买”，并支付订单，完成服务购买。 购买成功后，需要大约30分钟时间完成服务自动部署，请耐
计算资源列表 计算资源标签管理 标签管理：可通过设置系统内置标签“copy-in”，使作业在该计算节点上运行。用户也可以自定义标签，创建应用时，通过设置标签指定应用运行在具有相同标签的计算节点上，实现运行作业按标签进行调度。 调度设置：设置为“不可调度”后，作业将无法运行到此计算节点。 图4
“事件”。 图1 作业详情 如果作业显示运行正常，但实际作业中的某一个应用运行失败，请检查输入数据是否正常，并修改算法程序入口的main函数，保证运行结果有显式的返回值。 故障说明 作业运行时，每个应用称之为一个任务（Task）。部分场景下，任务输入数据异常，实际作业运行失败，但界面显示运行正常。
一年；如果选择的“按需”计费，无需选择购买时长。 勾选自动续费后，系统将在产品到期前自动续费，无需用户再手动操作。按月购买，自动续费周期为一个月。 单击“下一步”，确认订单详情。 单击“立即购买”，并支付订单，完成服务购买。 购买成功后，需要大约30分钟时间完成服务自动部署，请耐
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。 例如，使用health
通过修改--input，修改输入数据。 选择时，input和input-file二选一。 作业运行时，每个应用称之为一个task，应用可以设置多个输入参数，一个输入参数可以设置多个输入值。 task间使用;;分隔，input的参数路径间使用;;分隔。 例如task1.input
表示执行更新某行操作。--update、--delete 、--insert必须要传其中一个，三选一。 --delete -d 否 表示执行删除某行操作。--update、--delete 、--insert必须要传其中一个，三选一。 --insert -i 否 表示执行插入数据行操作。--update、--delete
详细可参考存储类别。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围：1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月，最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果支付时间晚于指定生效时间，资源包将在支付后立即生效。
径数量增加，将展示更多的合理合成路径；路径数量减少，可能会有部分合理路径未展示。默认值50，取值范围1-50。 最大搜索深度：深度增加，每一个路径可进行搜索的深度限制增加，作业运行时间可能延长；深度减少，部分路径可能在还未搜索完成时被终止。默认值5，取值范围3-12。 最大搜索时
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