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NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。 例如，使用health
单击“流程文件”后面的“添加”，添加流程文件。 如果流程文件上传的是zip包，则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf，为压缩文件夹中的文件完整路径。例如：main.nf。若不填写，默认为main.nf。 支持上传的文件格式为nf、 zip，大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个，单个文件解压后限制，不超过10M。
<project-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 是 项目名称。 --description -d 否 项目描述。 -tags -t 否 项目标签，多个标签使用分号(;)分隔。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。
"version" : "1.0.0", "summary" : "summary", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "create_time"
"baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "priority" : 0,
"baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-workflow", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "create_time"
最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 标签名称 最小长度：1 最大长度：32 description 否 String 标签描述 最小长度：0 最大长度：1024 响应参数 状态码： 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型
"labels" : [ "label1", "label2" ], "summary" : "summary", "description" : "description" } 响应示例 状态码： 202 OK { "id" : "0025ec57-9403-4a67-ae5f-ff79ffa847f7"
"title" : "title", "summary" : "this is summary", "description" : "this is description", "picture" : "data:image/png;base64,xxxxx", "labels"
最大长度：4 total_part 否 String 分段总数，上传的文件总共分成了几个片段 缺省值：1 最小长度：1 最大长度：4 multipart_id 否 String 分段上传任务id，除了第一个片段外，后续的片段都需要标识出任务id 最小长度：1 最大长度：128 file_name
wget zip # 下载FastQC，解压缩，设置FastQC可执行权限 RUN wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip \ && unzip fastqc_v0
d}/nextflow/workflows { "name" : "demo-workflow", "description" : "description", "labels" : "labelA,labelB", "workflow_file" : "(binary)"
"56e0f1b0-ac10-46a5-8fa7-b26831d7d488", "name" : "demo-instance", "description" : "description", "template_id" : "56e0f1b0-ac10-46a5-8fa7-b26831d7d488"
当前用户在该项目上的角色 size Long 项目桶存储量 status String 项目状态 tags Array of strings 标签列表 description String 项目描述 create_time String 项目创建时间 update_time String 项目更新时间 delete_time
"custom_prop_name", "type" : "numerical", "description" : "custom_prop_description" } } ] } 响应示例 状态码： 201 CPI成功提交响应，返回CPI任务ID "
_project_id}/nextflow/jobs { "name" : "demo-job", "description" : "description", "labels" : "labelA,labelB", "workflow_id" : "caadc
objects 标签详情 表4 LabelRsp 参数 参数类型 描述 id String 标签id name String 标签名称 description String 标签描述 creator String 标签创建者 create_time String 标签创建时间 update_time
t-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 description 是 String notebook描述信息，取值范围[0,1024] 最小长度：0 最大长度：1024 响应参数 无 请求示例
"zb_test:/a/b/Docking-202401091947-6sn7_complex_7abc.zip", "filename" : "Docking-202401091947-6sn7_complex_7abc.zip" } 状态码 状态码 描述 200 查询分子或分子复合物批量下载任务详情响应体。
"custom_prop_name", "type" : "numerical", "description" : "custom_prop_description" } } ] } 响应示例 状态码： 201 分子优化任务成功提交响应，返回分子优化任务ID
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