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输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径,可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览,zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题: 运行作业
"baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "description" : "description", "status" : "RUNNING", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z"
"demo-workflow", "version" : "1.0.0", "summary" : "summary", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "timeout" : 1440
afca-e2fd05f0824d", "type" : "APP", "chip_type" : "X86", "description" : "description", "tags" : [ "v1.1" ], "create_time"
"description" : "description", "import_data" : { "files" : [ "test-project-01:/db_test1.txt" ], "delimiter" : "string", "skip_lines"
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custom-props { "name" : "my_custom_prop", "description" : "my_custom_prop_description", "type" : "binary", "smiles" : [ "c1ccccc1",
镜像名称。 tag-name 无 是 镜像tag名称。 --description -d 否 描述。 --type -t 否 镜像类型,可选APP、NOTEBOOK或OTHER,不填写默认为OTHER。 --chip -c 否 芯片类型,只支持X86和ARM。 --project 无
/images { "description" : "this is a demo image", "name" : "demo-image", "tag" : "v1.0", "type" : "APP", "chip_type" : "X86" } 响应示例
"demo-app", "version" : "1.0.0", "summary" : "summary", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "image" : "gwj-
"baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "COMPLETED"
"custom_prop_name", "type" : "numerical", "description" : "custom_prop_description" } } ] } 响应示例 状态码: 200 ADMET成功响应 { "custom_props"
ns/{version} { "summary" : "this is summary", "description" : "this is description", "picture" : "data:image/png;base64,xxxxx", "labels"
String 镜像类型。枚举值:APP、NOTEBOOK 枚举值: APP NOTEBOOK description 否 String 描述信息 最小长度:0 最大长度:1024 chip_type 否 String 镜像芯片类型。枚举值:X86、ARM 枚举值: X86 ARM 响应参数
"56e0f1b0-ac10-46a5-8fa7-b26831d7d488", "name" : "demo_name", "description" : "description", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z" } ] } 状态码
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health
"custom_prop_name", "type" : "binary", "description" : "custom_prop_description" }, "metrics" : [ { "name" : "rmsd",
gromos53a6, gromos54a7力场,默认是amber99sb。 水模型:水模型支持spc, spce, tip3p, tip4p, tip5p类型,默认是tip3p。 离子种类:支持NaCl、MgCl2、None几种类型。若平衡电荷设置为True,则不支持离子种类选择None。
单击“流程文件”后面的“添加”,添加流程文件。 如果流程文件上传的是zip包,则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf,为压缩文件夹中的文件完整路径。例如:main.nf。若不填写,默认为main.nf。 支持上传的文件格式为nf、 zip,大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个,单个文件解压后限制,不超过10M。
<project-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 是 项目名称。 --description -d 否 项目描述。 -tags -t 否 项目标签,多个标签使用分号(;)分隔。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。