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数据库(可选) 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能,可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
从其他项目导入模板 功能介绍 从其他项目导入模板 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-pro
获取示例数据 本示例中使用小分子化合物SMILES结构式文件和蛋白3D结构PDB文件作为输入数据,可通过如下方式获取。 登录医疗智能体平台,在“资产市场”中订阅“docking summary测试数据”至所需的项目中。 图1 示例数据 父主题: 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选
创建的数据库,可以执行删除和追加数据操作。数据库状态介绍如下: 可用:数据库正常,可以进行分子搜索使用。 等待中:数据库创建任务正在等待。 创建失败:数据库创建失败。 创建中:数据库正在创建。 追加中:数据库正在追加,此时数据库可以正常使用,搜索的数据库是正在追加过程的数据库。
0600元/GB 恢复完成后,会同时收取标准+归档存储两份钱。 存储空间单价*容量*剩余天数/30。超过90天不需要补。 用户每次恢复归档数据,按照流量收取费用。 用户的归档存储类型的归档数据不足90天删除,需收取相应费用,费用参照OBS存储费用。 用户可将归档数据恢复到项目桶,恢复到项目桶
基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后,在医疗智能体平台搭建NGS流程,执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能,通过获取示例数据,创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
删除数据库 功能介绍 删除数据库。 URI DELETE /v1/{project_id}/drug/databases/{database_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
创建数据库模板 使用create命令创建数据库模板。 命令结构 health create database template <template-name> [flags] 或者 health create db template <template-name> [flags]
导入数据库模板 使用import命令导入别的项目的数据库模板到当前项目,暂只支持导入单个模板。 命令结构 health import database template <template-id> [flags] 或者 health import db template <template-id>
获取用户OBS桶内对象 功能介绍 获取用户OBS桶内对象 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/customer-
用户权限介绍 表1 用户权限说明 用户类别 权限 最终租户 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、邮箱和手机号、重置密码、移除用户。 系统管理员 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、移除用户。 非系统管理员 无相关编辑权限。 父主题: 用户管理
更新药物数据库 功能介绍 更新药物数据库。 URI PUT /v1/{project_id}/drug/databases/{database_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
删除数据库模板 使用delete命令删除数据库模板。 命令结构 health delete database template <template-id> [flags] 或者 health delete db template <template-id> [flags] 表1 参数说明
instance-id 无 否 数据库实例 id,不填写时表示获取数据库实例列表,填写时表示获取数据库实例详情。 --data -d 否 是否查询数据库数据,需要和database-id参数一起使用。 --limit -l 否 限制量,默认为10,取值范围[0,1000],只有在--data参数使用时才生效。
eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数
推荐扫码认证(即时完成认证) 请参见如何进行扫码认证。 银行卡认证(即时完成认证) 请参见如何进行银行卡认证。 证件认证(1-3个工作日) 请参见如何进行证件认证。 企业账号 推荐银行对公账户认证(最快30分钟) 请参见如何进行企业银行对公账户打款认证。 企业证件认证(0-3个工作日) 请参见如何进行企业证件认证。
平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库实例id 最小长度:1
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据,需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求,将数据上传至项目中。 输入蛋白质,pdb格式,将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子,配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串,第二列为smiles名称,中间用tab键分割。
String 数据库类型。 status String 数据库状态。 description String 数据库描述。 create_time String 数据库创建时间。 update_time String 数据库更新时间。 creator String 创建数据库的用户名称。
获取数据归档列表 使用get命令获取数据归档列表。 命令结构 health get archive-config # 命令中的archive-config可替换为backup-config 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linu