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notebook命令 创建notebook 获取notebook信息 删除notebook 编辑notebook 启动notebook 停止notebook
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
Array of strings 搜索使用到的数据库集合 top_n Integer 期望返回的条目数 prop_names Array of strings 分子ADMET属性名列表 query query object 初始查询分子的属性信息 result Array of SearchResultItem
分子ADMET属性值列表 similarity Number 分子与初始分子的相似度 num_fulfilled_weak_constraints Integer 分子所满足的弱约束数量 score Number 分子的打分 表8 MoleculeConstraint 参数 参数类型 描述
numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表11 CustomProp 参数 参数类型 描述 id String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64
获取并使用命令行工具eihealth-toolkit 步骤1:获取认证信息 步骤2:下载并安装命令行工具eihealth-toolkit 步骤3:初始化配置 步骤4:查看与执行操作命令
是否必选 说明 ID 不涉及 否 流程ID,指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时,获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径,以yaml格式保存。如果没指定,则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health nextflow get workflow
修改性能加速资源 查询消息及已完成作业保留设置 修改消息及已完成作业保留配置 获取供应商logo和名称设置 修改供应商logo和名称配置 获取系统配额信息 获取消息中心消息列表
基础配置:选择“计费模式”、“当前区域”。 集群类型选择“Elasticsearch”,输入集群名称。 图2 基础配置 节点规格:参考自己的数据库大小。自定义数据库所需要的的CSS节点规格大于“4 vCPUs | 8GB”,不支持“4 vCPUs | 8GB”。 节点存储:建议选择“超高I/O”。
objects 分子合成规划中的分子 reactions Array of reactions objects 分子合成规划中的反应列表 synthesis_routes Array of SynthesisResultItem objects 分子合成规划的具体信息 表7 molecules
上传文件 引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”,选择配体对。 页面显示:正在规划自动路径,您也可以直接选择配体对后进行下一步。 待计算路径:选择待计算的路径。待计算路径起点是中心配体名称,终点是其他配体的名称。在相似度计算完成之前默认未勾选。您
searchable: true tips: string 将示例文件存储到当前所在路径的app.yaml文件中 health get db template --sample > app.yaml 父主题: 数据库管理命令
结果解释:大于-5.15 log cm/s代表具有较好的渗透性。 MDCK Permeability: MDCK细胞的表观渗透系数Papp用来估计药物进入人体的吸收效率。单位为cm/s。 结果解释:大于20 x 10-6cm/s代表具有较好的渗透性,2~20 x 10-6cm/s具有一般渗透性,小于2
--cpd -C 否 生成断点记录文件的文件夹,默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段移动任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下,分段任务执行成功后,对应的断点记录文件会被自动删除;分段任务执行失败或
w。 --e -P 附加参数,可选 指定终端节点。 --i -i 附加参数,可选 指定用户的AK。 --k -k 附加参数,可选 指定用户的SK。 --t -n 附加参数,可选 指定用户的securitytoken。 命令示例 health stat huo:/huo/ --bf
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 job id,不指定job-id时,列出当前project的全部job的基本信息。 --type -t 否 查询类型,默认detail。此参数用于获取作业列表。 取值:logs、detail、reports 。