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cOS环境使用方法基本相同,可参考。 不指定参数。 执行health get project命令获取当前用户有权限访问的项目列表。 指定“project-name”参数。 例如查看名为“test-zh-0507”项目信息,执行health get project test-zh-0507命令。
返回的对象名称按照字典序排列。同时,该命令支持显示引用的其他项目的数据。 在使用该命令前,需要使用switch命令进入待操作的项目,才可以执行数据相关操作,使用逻辑与EIHealth平台相同。 命令结构 health ls <path> [flags] 表1 参数说明 参数 简写
oolkit进行初始化配置。本节以Windows为例介绍配置过程,Linux和macOS环境配置过程相同。 方法1:使用账号、密码初始化 执行以下命令,进行初始化,命中的xxx和region信息请参考表2进行替换。 Windows版命令行工具 health.exe config add
zip?AccessKeyId=VQ52M3Q7I4WPWPDUB5XZ\u0026Expires=1678139581\u0026Signature=XmQTSYDCq2Xl2pVDVE4S%2BoMBH3M%3D" } health nextflow get workflow
最小长度:1 最大长度:120 数组长度:1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除子结构。 operator 否 String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表12 InteractionConstraintDto 参数 是否必选 参数类型 描述 interactions
最小长度:1 最大长度:120 数组长度:1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除子结构。 operator 否 String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表12 InteractionConstraintDto 参数 是否必选 参数类型 描述 interactions
通过在本地修改流程的yaml模板,上传流程至项目中。 获取流程yaml模板。 单击“上传流程”,在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具,执行health get workflow -s命令获取创建流程的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.txt文件,保存
数据路径和流程图 图4 设置数据库 设置完成后,单击“提交”,执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务,单击图标,允许取消、强制停止或删除。 对于“已取消”、“运行失败”的任务,单击图标,允许修改任务参数,再次提交任务。 图5 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计出
包括状态、标签、描述、创建时间、完成时间、总耗时等。 对于执行失败的作业,鼠标点击作业状态,在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。 作业相关信息 在详情页可以查看作业执行命令、配置参数、流程配置文件、执行日志、报告信息。 图1 作业相关信息 Tasks相关信息 在
镜像启动命令。设置方法请参见创建FastQC应用样例。 --image -i 否 镜像地址。获取方法请参见获取镜像地址。 --labels -l 否 标签,多个标签使用;符号分隔开。 --nodeLabels -n 否 用于让应用调度到设置了该标签的节点上。 标签数量取值范围[0,1]。单个标签最大长度为63字符,必须以health
命令中的archive可替换为backup 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 archive-name 无 是 归档名称。 --path -p 是 归档的数据路径,多个对象用分号(;)分隔,开头不需要加/。例如, "xxx";"yyy"。 --description -d 否 归档描述。 --delete
t/ 图3 客户端 使用Linux版本命令行工具时,您需要在本地搭建Linux环境,并将下载的health文件放至所需的目录下。macOS执行命令和linux一致, 如果当前目录为health所在目录,可以使用./health命令使用命令行工具。 如果当前目录不是health所在
性操作,即要么不执行,要么需要执行过程不能中断。在执行完成后,“取消”操作才能生效。 删除:运行中的任务不支持删除,只可删除运行结束的数据。 重试:可对执行失败的任务从失败位置进行重试。 图1 数据作业 复制数据 在“数据”页面,使用“复制”,将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。
发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。 平台为您提供高性能、高可靠性、高性价比的计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行,提升医疗健康的服务能力和普惠水平。同时通过丰富的加速技术,实现算法工具的数倍加速,加速生物医疗大数据的分析。 平台由项目管理、数据管理、
/DATASET,支持查询多个,以','分隔 最小长度:0 最大长度:2000 key_word 否 String 关键字,支持在资产名、资产标题、短描述、长描述中搜索 最小长度:0 最大长度:2000 labels 否 String 标签,支持查询多个,以','分隔 最小长度:0
JupyterLab”,然后选择“Terminal”,进入Terminal界面。 图5 Terminal 例如,您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图6 执行命令 父主题: 开发环境(Notebook)
列名 列的名称不可以和PostgreSQL 11版本的关键字冲突。 是否主键 主键用于唯一地标识数据表中的信息,可通过设置复合主键将数据表中的多个数据设置为唯一,主键至多设置10个。 允许为空 主键所包含的列不允许设置为空。当数据库中某些数据允许没有值时,可设置为空。 是否可查询 依
eihealth.01010063 Could not find the corresponding bound device information. 请检查是否绑定了对应设备。 400 eihealth.01010064 The status of the performance resource
者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执行重试、取消、删除、克隆、导出操作。对于列表中的作业,支持通过作业名称、流程名称、标签、创建者、状态、创建时间和完成时间进行快速搜索。 如果需要批量创建分析作业,您可以创建自动作业。 当作业执行超时,作业状态显示失败,task状态为运行
在用户的操作列,单击“删除”,删除对应的用户。 图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户,不支持删除,只支持移除。移除后不影响该用户操作其他服务。执行移除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用