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import_app_results Array of ImportAppRsp objects 导入应用详情 表5 ImportAppRsp 参数 参数类型 描述 source_app_id String 源应用id destination_app_id String 目标应用id destination_app_name
# 子任务的参数数值，格式为${task_name.output_name}，表示连线关系，即app1-2需要app1-1成功执行后才会运行 - '${app1-1.output-dir}' 上传流程模板。 单击“上传流程”，在弹出的页面中上传yaml模板。
src_project_name在使用导入or订阅的资源是需要填写，为空表示本项目 # 2. 其他场景，app_id为系统分配的唯一标识 app_id: xxx # 必选 app唯一标识 name:
上一步骤中，已经将fastqc镜像上传至平台，本步骤使用fastqc镜像创建应用。 进入“工具 > 应用”界面。 图2 进入应用界面 单击“新建应用”，创建fastqc应用。 图3 设置镜像名称、版本等信息 镜像启动命令如下所示。镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量，并以大括号{}扩起，以$符号进行引用。
本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例，帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检查工具，此样例基于开源的FastQC软件，将软件制作成镜像，上传至平台，并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直接使用FastQC应用，或将其编排至流程，和其他应用一起使用。 创建
发布流程 您可以将创建的流程发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“流程”。 选择需要发布的流程，单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面，填写发布流程的相关信息。 表1 发布流程参数说明 参数 说明 名称
配体格式转换为SMILES 功能介绍 配体格式转换为SMILES，若配体文件中存在多个分子，则只取第一个返回。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles
file 是 ConvertFile object 待转换文件。 in_format 是 String 待转换文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI。 最小长度：0 最大长度：6 out_format 是 String 转换后文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI。 最小长度：0
添加分类标签 为了方便分类查看创建的应用和流程，您可以使用分类标签功能，筛选呈现带有相同标签的应用或流程。 在“工具”页面左侧，单击图标新建分类标签。 在添加分类标签弹窗中，输入“名称”，勾选需要呈现的标签名称。最多可以勾选5个标签。 图1 添加分类标签 勾选完成后单击“确定”。
、更新和删除标签等操作。 应用管理 应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 您可以使用该工具创建应用，并进行修改、删除、查询、导入操作。 流程管理 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义，流程至少由一个应用组成。 您可以使用该工具创
使用get命令获取当前用户有权限访问的所有项目列表，以及项目信息，包含项目名称、ID、所有者、项目角色、存储大小、状态、创建时间、更新时间。 在使用该命令前，您需要通过平台创建项目。 命令结构 health get project <project-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写
级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu 否 String gpu申请使用量，取值范围[0-16]，仅支持整数，Snt9有特殊约束，申请数量需要是0,1,2,4,8。对于应用，不填默认0；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配
数据库（可选） 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能，可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题： 购买计算资源（主账号操作）
AK/SK认证：通过AK（Access Key ID）/SK（Secret Access Key)加密调用请求。 Token认证 Token的有效期为24小时，需要使用同一个Token鉴权时，可以缓存起来，避免频繁调用。 Token在计算机系统中代表令牌（临时）的意思，拥有Token就代表拥有某种权限
【可选】单击“镜像类型”，对上传的镜像进行分类。 上传镜像时如果上传命令中未指定镜像类型，新上传的镜像默认显示为“OTHER”，您可以将镜像标记为“APP”或“NOTEBOOK”。 APP：用于创建应用的镜像。 NOTEBOOK：用于创建Notebook的镜像。 为了保证平台业务安全，您在平台内购买的计算资源，将部
输入分子页面 在白框内输入需要优化的小分子SMILES表达式或者上传分子文件。 上传的文件支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式。 图2 输入分子 单击“下一步”，进入靶点设置，此步骤为可选步骤，如果需要设置靶点，并且将对接结合能作为一个约束条件进行优化，需要进行配置。最多可添加2
可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。 图2 查看订阅的应用 步骤2：新建流程 在“工具 > 流程”页面，单击“新建流程”按钮，填写流程名称，版本等信息。 图3 新建流程 利用拖拽的方式将左侧边栏应用列表中的需要执行的应用拖拽到中间画布上，这里我们将fastp，bwa-mam，
关系：作业->流程->应用 gpu: '0' # gpu申请使用量，取值范围[0-16]，仅支持整数，Snt9有特殊约束，申请数量需要是0,1,2,4,8 。对于应用，不填默认0；对于流程和
"last_timestamp" : "2021-01-30T02:34:36Z", "message" : "创建k8s Job对象 app1-1-0-093a002fa000217 成功", "reason" : "创建成功##SuccessfulCreate",
配额说明 为防止资源滥用，平台限定了各服务资源的配额，对用户的资源数量和容量做了限制。 如果当前资源配额限制无法满足使用需要，您可以申请扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下： 统一身份认证（IAM） 容器镜像服务（SWR） 对象存储服务（OBS） 关于如何查看配额，如何申请扩大配额，请参见“《用户指南》
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