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在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
方案概述 方案应用 HPC提供了超高浮点计算能力解决方案,可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求,如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等,缩短需要的大量计算时间,提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需
传统的HPC使用中存在如下问题: 投资成本高,扩容部署复杂,重复利用已有投资十分困难。 应用复杂,资源预测困难,灵活性差,亟待提升效率。 效率低下导致决策缓慢,失去市场、以及开发研究成果的良机。 应用计算量快速膨胀,对性能要求越来越高。 公有云上应用HPC场景,能充分利用云服务的优势。使用公有云进行高性能计算具有以下优势:
在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景) 该任务指导以CentOS 7.6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在集群上运行MPI应用。 IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id
processes entering MPI_Finalize 在Linux集群上部署您自己的MPI 应用,并参考上述MPI运行方法,在Linux 集群中运行MPI 程序。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(3.1.0rc2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 该任务指导用户在鲲鹏BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(以版本4.0.2a1为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI(X86 BMS场景) 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
停止集群 操作场景 按需类型的集群,如暂时没有任务需要执行,可使用集群停止功能对集群进行管理操作以节省费用。 包周期资源不适用,关机后仍继续扣费,需手动退订后可停止扣费。 有集群状态为“运行中”的集群可进行停止操作。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。
它提供了基于RDMA之上的IP网络模拟层,允许应用无修改的运行在InfiniBand网络上。但是,IPoIB性能比RDMA通信方式性能要低,大多数应用都会采用RDMA方式获取高带宽低延时的收益,少数的关键应用会采用IPoIB方式通信。 无修改:指运行在IP协议上的应用不需要作任何修改,即可适配IB网络运行。
融合以太网的特性,但是RoCE协议也可以使用在传统以太网网络或者非融合以太网络中。 应用场景 网络密集型应用,例如存储或者集群计算等,需要网络支持大带宽和低时延特性。RDMA的优势相比其他网络应用程序接口,例如Berkeley接口,就是低时延,低CPU负载和大带宽。RoCE可以比iWARP协议要实现更低的时延。
HPC-S²应用场景与使用限制 HPC-S²应用场景 计算资源创建:HPC-S²支持一键式报价和一键式购买HPC集群,并在创建集群时自动部署所配置的调度器、域控制器以及运行时的依赖。 计算资源配置:HPC-S²支持计算资源的多种配置管理,包括集群管理、节点管理、扩容集群节点及资源状态查看等。
为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。如您最多可以创建多少台弹性云服务器、多少块云硬盘。 如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以申请扩大配额。 怎样查看我的配额? 登录管理控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 在页面右上角,选择“资源 > 我的配额”。
IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
按需购买的集群删除时未勾选“删除云服务器”,因此只删除了集群信息,集群中的云服务器资源仍在继续扣费。 包周期类型的集群删除时只能删除集群信息,云服务器资源需要手动退订。 管理节点如使用购买EIP的选择,集群删除时,即使勾选了“删除云服务器”,绑定的EIP资源也不会删除,仍然正常计费。如需停止EIP资源计费,请手动删除EIP。
Intel MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Intel MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel
3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用