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将1中下载的HPC-X压缩包上传至运行MPI的弹性云服务器内。 执行以下命令,解压HPC-X工具套件。
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
假设集群中有2个弹性云服务器,另一个云服务器的主机名为hostname2,则命令行为: $ ssh 用户名@SERVER_IP $ ssh hostname2 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel MPI benchmark。
在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
6 虚拟私有云(VPC) 为云服务器等云上资源构建隔离、私密的虚拟网络环境。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘(EVS) 为ECS、BMS等计算服务提供持久性块存储的服务。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的版本需要提前适配RoCE,请联系技术支持进行操作,建议使用推荐版本运行STAR-CCM+。
基于消息的事务:数据被作为离散消息处理,而不是作为流,这消除了应用将流分成不同消息/事务的需要。 分散/收集条目支持: RDMA支持本地处理多个分散/收集条目,即读取多个内存缓冲区并将其作为一个流或获取一个流并将其写入多个内存缓冲区。
安装和使用MPICH 操作场景 本节指导用户在鲲鹏BMS集群上安装和使用MPICH应用(以版本mpich-3.3.2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https:
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-
管理共享存储 操作场景 HPC解决方案服务的管理控制台提供了弹性文件服务SFS的自定义挂载和卸载的功能。集群创建完成后,您可以在共享存储页面为集群挂载/卸载弹性文件服务。通过弹性文件服务SFS为集群提供共享存储的功能。 当集群为运行状态时,您可以选择挂载/卸载弹性文件服务。
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以4.0.2版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi
IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102