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合成路径规划 合成路径规划基于盘古药物分子大模型，根据给定的目标分子，可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。
新建分子合成路径规划任务接口 功能介绍 输入要进行合成路径规划的分子以及输出可行方案的个数。
分子合成路径规划任务（MSP） 新建分子合成路径规划任务接口 查询分子合成路径规划任务 父主题： API（AI辅助药物设计）
创建分子合成路径规划作业 功能介绍 创建分子合成路径规划作业。
分子合成路径规划作业管理 创建分子合成路径规划作业 查询分子合成路径规划作业详情 父主题： API（盘古辅助制药平台）
查询分子合成路径规划任务 功能介绍 通过分子合成路径规划任务ID查询分子合成路径规划任务状态及结果。
查询分子合成路径规划作业详情 功能介绍 查询分子合成路径规划作业详情。
Score：代表小分子可合成性的综合打分。 Vina Score：代表分子如果添加了靶点，将会计算对接结合能。 Similarity：靶点口袋分子设计后的分子与原始分子的相似度。 QED：代表分子的成药性。
API（盘古辅助制药平台） CSS集群管理 药物通用接口 药物数据库管理 药物作业管理 自由能微扰作业管理 分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI
API（AI辅助药物设计） 分子生成（MG） 分子优化（MO） 靶点化合物结合预测（CPI） 分子属性预测（MPP） 分子搜索（MS） 分子合成路径规划任务（MSP） 自定义属性任务（MCP）
SaScore：代表合成可及性分数，旨在评估分子的合成难易程度。 查看作业信息 点击作业的“作业信息”页面可以查看作业的运行时间和配置参数。 图14 查看作业信息 聚类分析 目前分子对接返回的结果小分子数较多，无法进行批量分析，通过一些聚类的 辅助方式能更好的选择分子。
使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。
作业管理简介 在作业中心页面，可以创建分子对接、分子优化、自由能微扰、合成路径规划功能的作业。 在“作业中心”页面，以列表形式展示了项目中作业的运行状态。您可以查看作业的名称、创建时间、运行状态、总时长、运行时长、已运行时间、预计还需时间。
NGS流程简介 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅地提高了测序速度，有力推动了相关研究。
先导化合物优化 分子优化 靶点口袋分子设计 自由能微扰 合成路径规划 父主题： 功能模块
下游分析：分子优化对应的下游分析为分子优化、分子搜索和合成路径规划，单击“确定”即可创建。 每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数QED、SaScore QED：代表分子的成药性。 SaScore：代表合成可及性分数，旨在评估分子的合成难易程度。
先导化合物优化 在先导化合物优化阶段，提供分子优化、靶点口袋分子设计（骨架跃迁、片段优化、片段连接、片段生成）、自由能微扰、合成路径规划功能。 模型管理 支持客户用自己的数据进行模型训练、对模型进行管理以及在平台上用自己的模型进行分析。 父主题： 盘古辅助制药平台
SaScore：代表合成可及性分数，旨在评估分子的合成难易程度。 图13 查看结果（2） 单击“查看3D”，可以看到分子的3D构象，如果设置了靶点，还可以看到优化后的小分子与靶点的结合构象。 如果上传了双靶点，可以通过切换来切换靶点，查看相应靶点和优化后分子的结合构象。
使用Variant Calling Based On NGS流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。
在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息，可以在操作列查看3D、合成路径等信息。 图1 输出结果-列表视图 输出结果除了支持上图所示的列表视图外，还支持卡片式图和3D视图。
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