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特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。 类型 应用。 标签 设置发布应用的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的应用设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此应用的相关描述。 单击“立即发布”。
测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合,将不同结构叠合在一起,用于比较结构差异。 输出指定蛋白口袋的位置及大小,用于分子对接。 导出不同分辨率的图片文件。 播放与制作分子动力学轨迹动画。 父主题: 通用工具
结合能,并按照Vina Score进行排序 Score:代表优化后小分子的综合打分。 Similarity:代表优化后的分子与原始分子的相似度。 QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。 图13 查看结果(2) 单击“查看3D”
Dockerfile方式制作镜像常用命令示例: 本例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,制作centos镜像,并在镜像中放入图片文件。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”,输入ECS初始账号,登录ECS。
BaseRecalibrator 基于比对bam文件评估矫正参数。 gatk-bqsr:4.1.9.0 gatk ApplyBQSR 基于比对bam文件进行矫正。 gatk-applybqsr:4.1.9.0 gatk HaplotypeCaller 基于比对和矫正之后的bam文件进行Variant
smiles String 分子SMILES表达式 source String 分子所属的数据库来源 score Float 分子与查询分子的相似度 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 分子搜索任务查询成功响应
String 账号id 最小长度:1 最大长度:32 name String 名称 最小长度:1 最大长度:100 logo String logo图片base64编码 最小长度:0 最大长度:1500000 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "vendors" : [
最大长度:128 description 否 String 长描述 最小长度:0 最大长度:65535 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 labels 否 Array of strings 标签列表 最小长度:1 最大长度:32
最小长度:1 最大长度:24 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 summary 否 String 短描述 最小长度:0 最大长度:128 description
最小长度:1 最大长度:56 version 是 String 资产版本 最小长度:1 最大长度:24 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 summary
ants数据集。 输出 FastQC Report 原始测序数据的质控报告,以HTML文件形式展示。 输出 BamQC Report 测序比对数据的质量控制报告,以HTML文件的形式展示。 输出 VCF 样本的突变信息,包含有SNP和INDEL信息,以VCF的格式存储。 输出 VCF
Dockerfile方式制作镜像常用命令示例: 本例中使用华为云弹性云服务器服务(ECS)创建一台云服务器,制作centos镜像,并在镜像中放入图片文件,讲解Dockerfile常用命令使用方法。 购买弹性云服务器。 云服务器创建成功后,在云服务器列表页,选中待登录的弹性云服务器。单击
最小长度:1 最大长度:64 title 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 summary 否 String 短描述 最小长度:0 最大长度:128 description
最大长度:128 description 否 String 详细描述 最小长度:0 最大长度:65535 picture 否 String 封面图片base64编码 最小长度:0 最大长度:50000 labels 否 Array of strings 标签列表 最小长度:1 最大长度:32
score 靶点口袋分子设计后的分子的vina score分数。 similarity 靶点口袋分子设计后的分子与原始分子的相似度,计算的是ECFP4 Tanimoto相似度。 score 优化后小分子的综合打分。 Vina Score1 分子优化如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina
分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 similarity Number 分子与初始分子的相似度 num_fulfilled_weak_constraints Integer 分子所满足的弱约束数量 score Number 分子的打分
-l 否 批量下载时,不包含上一级父对象名前缀,批量下载时可选。 --update -u 否 增量下载操作,设置该参数后,下载每个文件时会比对本地的文件,仅在以下情况时下载数据: 文件不存在。 下待载文件大小与本地文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。 命令示例 本节以Wi
-l 否 上传文件夹时,只上传该文件夹下的所有内容,上传文件夹时可选。 --update -u 否 增量上传操作,设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件,仅在以下情况时上传数据: 文件不存在。 待上传文件大小与平台文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。 命令示例
分子对接结果pdbqt文件所在的文件夹。 输出参数 dir-out directory 分子对接结果汇总信息(矩阵.xlsx、3D可视化文件.pdb、配体及受体结构图片.svg等)所在的文件夹。 参数填写无误后,单击界面上方“启动作业”,运行作业。 步骤4:查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业”页签,单击创建的Docking
05 实践 基于EIHealth平台,搭建NGS流程,流程以fastq格式数据作为输入,对碱基的质量信息进行评估,判断可靠程度,通过质控、比对、变异检测等步骤,最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 基于二代测序的基因突变检测 NGS流程简介 操作步骤 快速创建一个kubernetes集群