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py37 生成Notebook kernel。 conda install -n py37 ipykernel python -m ipykernel install --user --name py37 --display-name "conda_py37" 使用新生成的Notebook
分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI作业管理 靶点优化作业管理 聚类分析作业管理 药物模型管理
命令结构 health clear [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 upload -u 是 上传文件时,本地生成的断点目录。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
--fr -R 否 下载对象时生成结果清单文件。 --tempFileDir -D 否 分段下载时保存临时文件的文件夹,默认为配置文件中的defaultTempFileDir。 如果该值为空,且配置文件中的defaultTempFileDir也为空,则分段下载时生成的临时文件会保存在待下载文件的同目录下并以
对于输入参数,打开“并发”开关,在启动作业时,每个参数可以设置多个参数值,自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如,存在输入参数a和输入参数b,在启动作业时,分别给参数a设置了2个参数值,给参数b设置了2个参数值。那么,系统将自动生成4个作业并发执行。 对于输出参数,如果镜像启动
--delimiter -e 否 常用的三种分隔符为(;,\t),也可以根据导入数据的文件格式设定其他分隔符。 --files -f 否 生成实例数据的文件列表,多个文件用分号(;)分隔。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 smiles 是 String 分子SMILES表达式 num_trials 否 Integer 生成分子数量 strong_constraints 否 Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints
设置名称匹配模式(include、exclude)和时间匹配模式(timeRange)对文件夹也生效。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果、失败结果、警告结果三个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
最大长度:128 smiles String 分子SMILES表达式 num_rounds Integer 总生成轮数 num_trials_per_round Integer 每轮生成数量 num_expected Integer 期望条目数 num_strong_constraints
创建study、列举study、删除study等相关操作API。 表2 临床研究、AI辅助药物设计API 类型 API 说明 药物设计 API(AI辅助药物设计) 分子生成、分子优化、靶点化合物结合预测、分子属性预测相关操作API。
邮箱地址:填写邮箱地址,用于发送EIHealth平台的消息通知。 用户名:邮箱的用户名,如果未修改过,默认为邮箱地址。 密码:邮箱开通SMTP功能时生成的一段随机字符。 消息头:发送邮件时,邮件标题。 语言:选择中文或英文。 删除邮箱后,将不再发送邮件通知。 图1 邮件配置 邮箱配置完成后
设置名称匹配模式(include、exclude)和时间匹配模式(timeRange)对文件夹也生效。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果、失败结果和警告结果三个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
设置名称匹配模式(include、exclude)和时间匹配模式(timeRange)对对象名以“/”结尾的对象也生效。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果、失败结果和警告结果三个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
设置名称匹配模式(include、exclude)和时间匹配模式(timeRange)对对象名以“/”结尾的对象也生效。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果、失败结果和警告结果三个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
successfully! 执行以上命令,会在系统所在的用户目录下自动生成“.health”文件夹,文件夹中包含config.ini配置文件,用于存储任务执行所涉及到的配置,如密钥、区域、当前项目等信息。 生成的配置文件不建议直接修改,如需改动请使用命令行工具修改。 配置文件中保
作业名称:可选择“数据库表”、“自定义”或“自动生成”。 标签:设置作业标签。 描述:根据需要填写。 输出路径:可选择“数据库表”和“自定义”。选择“自定义”时,存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 可选: 流程的ID(workflow-id),使用命令行工具创建流程时生成。示例请参见创建流程命令示例。 流程的名称、版本、所在项目名称(workflow-name:version:srcproject),src
# 'GPU数量' output_dir: # task输出子目录,默认为空时,自动生成task-name子目录,允许在workflow中配置 inputs: # 输
ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 可选: 应用的ID(app-id),使用命令行工具创建应用时生成。示例请参见创建应用命令示例。 应用的名称、版本、所在项目名称(app-name:version:srcproject),srcproje
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