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创建Notebook时，平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像，依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像，您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务，参考步骤1.连接容器镜像服务操作，然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。
检查购买的CSS资源状态是不是正常的。 检查购买的CSS资源是不是绑定了公网IP。 已绑定的集群修改了密码或者公网IP。 在平台侧需要解绑并重新绑定。 CSS资源到期。 在云搜索服务的集群管理列表页，找到需要续订的计费模式为“包年/包月”的集群。 单击操作列的“更多 > 续费”，确定后进入续费页面。
使用docker push命令将镜像上传至EIHealth平台。 # –t APP 可不加，在平台上也可以对其进行设置 health docker push user-tutorials/fastqc:latest –t APP 上传成功后，可以转至平台查看已经上传的镜像。 步骤3：创建fastqc应用
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 流程”页签，单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”，其他参数可选填。参数填写完成后，单击“确定”，完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用，并使用鼠标拖拽至画布中。
引用OBS类型数据时，如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”，则将该数据引用过来后，该数据不能用于创建作业，并不可下载。 平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以引用OBS类型数据。平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以解除引用OBS类型数据。其他角色的用户仅能使用引用进来的OBS类型数据。
通过“数据”页面上传数据，支持上传最大为1GB的单个文件。 使用命令行工具上传 命令行工具（eihealth-toolkit）配套EIHealth平台，提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用，支持上传最大为48.8TB的单个文件。 父主题： Notebook
Key)：与访问密钥ID结合使用的密钥。 --region -r 是 服务区域名称。依据购买服务所在的区域进行选择，可选cn-north-4、cn-east-3、cn-south-1 --platform-id -i 是 平台ID，获取方法请参见获取认证信息。 --iam-endpoint
mem镜像和制作gatk-haplotypecaller镜像制作镜像。制作好后的镜像如图1所示，请按照以下步骤将镜像上传至EIHealth平台。 图1 NGS流程镜像 使用命令行工具，使用health switch project <project-name>命令进入待操作的项目。
并在该配置文件基础上进行修改，得到可以用于批量执行NGS的配置文件。本示例介绍使用方法一获取配置文件的方法。 方式一 使用EIHealth平台完成NGS流程的搭建，并执行成功，然后在“分析作业”页面导出作业信息.yaml文件。 方式二 使用命令行工具完成NGS流程的搭建，进而获取
请求发送以后，您会收到响应，包含：状态码、响应消息头和响应消息体。 状态码 状态码是一组从1xx到5xx的数字代码，状态码表示了请求响应的状态，完整的状态码列表请参见状态码。 对于获取用户Token接口，如果调用后返回状态码为“201”，则表示请求成功。 响应消息头 对应请求消息头，响应同样也有消息头，如“Content-type”。
执行分析作业 创建分析作业 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 流程”页签，单击NGS流程行的“启动作业”。 请参考配置输入和依赖数据章节，设置NGS流程数输入数据。 在新建作业页面，填写作业信息。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格
位点的“+”添加。最多可添加50个生长位点。 单击下一步，配置其余参数 分子量：自适应和手动输入。自适应模式下平台根据药物分子的分子量分布进行分子设计。手动输入模式下平台会将用户输入的分子量作为强约束对分子设计过程进行限制，不合适的分子量范围可能会导致没有结果输出。 选择属性模型
X-Auth-Token 是 String 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型
配体分子 选择上传的配体小分子文件。 受体蛋白 选择上传的受体蛋白文件夹。这里会默认用文件夹里面所有的蛋白质和配体小分子文件里面的小分子进行一一对接。 超时时间 根据受体配体对个数进行调整，一个受体配体对对接大约需要25s。 图2 运行信息 单击“提交”，运行作业。 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
获取消息中心消息列表 使用get命令获取消息中心消息列表。 命令结构 health get message [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --message-type -m 否 消息类型，根据消息类型筛选消息列表。 --resource-type -r
X-Auth-Token 是 String 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型
"props" : [ "C6H12", "base", 0, 0.163034, 0.43, 0.28 ] } ] } } 状态码 状态码 描述 200 CPI任务查询成功响应 404 CPI任务ID不存在 错误码 请参见错误码。 父主题： 靶点化合物结合预测（CPI）
"range" : [ 100, 600 ] } ], "binding_site" : null } } 状态码 状态码 描述 200 分子生成任务查询成功响应 404 分子生成任务ID不存在 错误码 请参见错误码。 父主题： 分子生成（MG）
-14.5 ], "size" : [ 10.0, 10.0, 10.0 ] } } } } 状态码 状态码 描述 200 分子优化任务查询成功响应 404 分子优化任务ID不存在 错误码 请参见错误码。 父主题： 分子优化（MO）
"props" : [ "C6H12", "base", 0, 0.163034 ] } ] } } 状态码 状态码 描述 200 分子搜索任务查询成功响应 404 分子搜索任务ID不存在 错误码 请参见错误码。 父主题： 分子搜索（MS）
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