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Nextflow 在使用Nextflow时,作业运行失败的可能原因
准备工作 购买服务 购买资源 购买CSS资源 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
系统设置 用户管理 资源中心 标签管理 个人设置 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
用户权限介绍 表1 用户权限说明 用户类别 权限 最终租户 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、邮箱和手机号、重置密码、移除用户。 系统管理员 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、移除用户。 非系统管理员 无相关编辑权限。 父主题: 用户管理
功能模块 靶点发现 苗头化合物发现 先导化合物优化 通用工具 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
苗头化合物发现 分子对接 分子属性预测 分子搜索 CPI预测 分子生成 父主题: 功能模块
先导化合物优化 分子优化 靶点口袋分子设计 自由能微扰 合成路径规划 父主题: 功能模块
--password 是 密码。 --region 是 服务区域名称。请依据实际购买平台的区域填写。当前支持华北-北京四(cn-north-4)、华东-上海一(cn-east-3)。 --platform-id 是 平台ID,获取方法请参见步骤1:获取认证信息。 方法2:使用AK、SK初始化
使用docker push命令将镜像上传至EIHealth平台。 # –t APP 可不加,在平台上也可以对其进行设置 health docker push user-tutorials/fastqc:latest –t APP 上传成功后,可以转至平台查看已经上传的镜像。 步骤3:创建fastqc应用
如何进行实名认证 实名认证入口 使用已注册的华为账号登录“华为云”。 单击账号名下拉框中的“账号中心”。 进入“账号中心”页面。 单击左侧导航中的“实名认证”,选择认证类型(个人认证/企业认证),根据页面提示进行实名认证。 实名认证类型介绍 表1 实名认证详细介绍 账号类型 认证类型(任选一种类型)
能对结果进行收藏,以下以分子对接模块为例,其他模块的收藏操作可在相应模块的介绍中查阅,请参考功能模块。 登录盘古辅助制药平台。 单击“进入平台”,进入药物平台操作页面。 单击“功能模块 > 苗头化合物发现 > 分子对接模块”,进入分子对接配置页面。 根据分子对接章节完成参数配置。
ix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1
None 医学文本标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行数据管理和标注 07:08 医学文本管理和标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行团队标注 05:44 医学文本团队标注 药物虚拟筛选 医疗智能体 EIHealth 药物虚拟筛选
若CSS集群显示“不可绑定”。 检查购买的CSS资源状态是不是正常的。 检查购买的CSS资源是不是绑定了公网IP。 已绑定的集群修改了密码或者公网IP。 在平台侧需要解绑并重新绑定。 CSS资源到期。 在云搜索服务的集群管理列表页,找到需要续订的计费模式为“包年/包月”的集群。 单击操作列的“更多
位点的“+”添加。最多可添加50个生长位点。 单击下一步,配置其余参数 分子量:自适应和手动输入。自适应模式下平台根据药物分子的分子量分布进行分子设计。手动输入模式下平台会将用户输入的分子量作为强约束对分子设计过程进行限制,不合适的分子量范围可能会导致没有结果输出。 选择属性模型
Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 操作步骤 登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 图1
引用OBS类型数据时,如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”,则将该数据引用过来后,该数据不能用于创建作业,并不可下载。 平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以引用OBS类型数据。平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以解除引用OBS类型数据。其他角色的用户仅能使用引用进来的OBS类型数据。
log为空,请提交工单或联系服务技术支持。 execution log 提示K8S pod can‘t be scheduled,请根据日志信息扩容计算资源。 execution log提示can't lock file,重试或者克隆作业即可。 execution log提示java.text
通过“数据”页面上传数据,支持上传最大为1GB的单个文件。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealth平台,提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用,支持上传最大为48.8TB的单个文件。 父主题: Notebook
mem镜像和制作gatk-haplotypecaller镜像制作镜像。制作好后的镜像如图1所示,请按照以下步骤将镜像上传至EIHealth平台。 图1 NGS流程镜像 使用命令行工具,使用health switch project <project-name>命令进入待操作的项目。