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STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id
修改Makefile文件02 执行以下命令,编译lammps,并将当前目录生成的lmp_mpi文件拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代100步生成一个checkpoint文件,假定该文件存放在共享目录“/share”中。内容如下:
world_size); //FinalizetheMPIenvironment. MPI_Finalize(); } 执行以下命令,生成可执行文件,假设在/home/linux目录下生成。 # mpicc hello.c -o spe_hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的,因此,
图2 环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 执行以下命令,重新生成可执行文件。 # cd # mpicc hello.c -o intel_hello 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。
Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 $ mpirun -np
图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2
which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ cd ~ $ vi hello.c 编辑内容如下: #include<mpi.h> #include<stdio
which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ cd ~ $ vi hello.c 编辑内容如下: #include<mpi.h> #include<stdio.h>
检查MPI环境变量 在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 假设hello.c文件在“/home/rhel/”目录下,生成的可执行文件名为hello,执行以下命令: $ cd /home/rhel/ $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上通过Spectrum
”、“/”、“^”、“,”、“{”、“}”和“?” 密码不能包含用户名或用户名的逆序。 YNbUwp!dUc9MClnv 说明: 样例密码随机生成,请勿复制使用样例。 选择“购买时长”。 计费模式为“包年/包月”类型,需同时选择购买时长,同时用户可选择是否需要“自动续费”,如勾选了“自动续费”,包周期到期后会自动续费。
密码不能包含用户名或用户名的逆序。 Windows系统的弹性云服务器,不能包含用户名中超过两个连续字符的部分。 YNbUwp!dUc9MClnv 说明: 样例密码随机生成,请勿复制使用样例。 选择 “弹性文件服务”。 弹性文件服务自动根据“网络配置”当中所选VPC筛选,如不存在弹性文件系统,需手动创建,并添
概述 操作场景 高性能计算解决方案适用于基因测序,工业仿真等高性能计算场景,您根据实际计算需求购买HPC集群。 本节操作介绍创建HPC集群的方式,以及创建流程,引导您一站式完成集群的创建、配置,并在HPC-S²上完成高性能计算作业。 部署方式简介 购买高性能计算解决方案:根据实际
密码不能包含用户名或用户名的逆序。 Windows操作系统的云服务器,不能包含用户名中超过两个连续字符的部分。 YNbUwp!dUc9MClnv 说明: 样例密码随机生成,请勿复制使用样例。 系统不会定期自动修改弹性云服务器密码。为安全起见,建议您定期修改密码。 高级配置 可选配置,如需使用“高级配置”中的
密码不能包含用户名或用户名的逆序。 Windows系统的弹性云服务器,不能包含用户名中超过两个连续字符的部分。 YNbUwp!dUc9MClnv 说明: 样例密码随机生成,请勿复制使用样例。 系统不会定期自动修改弹性云服务器密码。为安全起见,建议您定期修改密码。 设置集群名称。 名称可自定义,但需符合命名规则。集群名称命名规则如表3所示。