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时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被删除。在用户的操作列,单击“删除”,删除对应的用户。 图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户,不支持删除,只支持移除。移除后不影响该用户操作其他服务。执行移除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被移除。在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。
流程设计器 分析流程至少由一个应用构成,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流,一个应用的输出作为另一个应用的输入。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器,您可以拖拽工具到画布中,可视化链接各应用,指定应用的先后顺序。 流程设计器界面 流
组织共享 如果关闭,则该模型只能自己使用。 如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的模型做分析。 默认为关闭。 单击“确定”。 每人最多可以创建100个模型,每次使用模型时,最多可以使用10个。 查看模型列表 在AI模型页签下支持查看创建的所有模型。包括模型的名称、模型类
或者其它容器。多个容器可以通过同一个挂载点共享数据,即便其中一个容器已经停止,挂载点也仍然可以访问。 WORKDIR 为接下来执行的指令指定一个新的工作目录,这个目录可以是绝对目录,也可以是相对目录。根据需要,WORKDIR可以被多次指定。当启动一个容器时,最后一条WORKDIR
在EIHealth平台下载数据 下载数据操作会产生流量费用,计费方式为按需计费,计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面,展开数据文件夹,选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。
获取镜像 获取创建分析应用的镜像 创建分析应用时,您可以通过Docker Hub等镜像仓库,搜索引擎,自己制作等途径获取所需的镜像。 例如,可在Docker Hub获取bwa软件(用于将基因序列比对到参考基因组上)。 以下类型镜像,建议您通过Docker Hub获取,不建议自己制作。
行资源访问,保留期内资源处理和费用详见“保留期”。保留期满仍未续订或充值,数据将被删除且无法恢复。 当平台处于冻结状态,且资源不再使用,您可以进入EIHealth控制台,在操作列的“更多”中手动删除或释放平台。 图1 删除平台(按需计费) 图2 释放平台(包年包月计费) 父主题:
0行,每行最多输入1024个字符,SMILES不支持输入空格或者中文。 作业名称:设置作业名称。长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格,首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:100000个小分子记一次功能调用。 配置完成后,单击“提交”。
目中,一次至多导入50个应用。 使用“导入应用”功能,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入应用”,进入导入应用页面。 图1 导入应用 选择需要引用的项目以及项目中的应用,选择应用的版本。“导入应用名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。
我的发布 在“资产市场>我的发布”中可以查看该用户所有发布资产的情况。对于发布成功的资产,可以在“组织共享”中查看和订阅。 对于发布成功的资产,可以进行下线操作,下线后已经订阅的资产将不可使用。 图3 下线资产 对于发布失败或者下线的资产,可以进行编辑,删除,发布等操作。 在“我
ngularity结合起来使用,可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移,并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的程序模型,因此不用自己去写复杂的并行化的程序,只需要关注“数据流”即可。流程中的每个process可以通过配置文件快速的定制并行执行的样
用户,不算统计个数。例如,用户组A里50个用户,10个已经导入平台, 那么统计时,只会显示已选择40个用户。 IAM平台限制一个IAM用户不能加入超过10个用户组,而导入时还会再加入医疗用户组。如果IAM用户在导入平台之前就已经加入了10个用户组,则导入的时候会失败。 用户数统计时会去重。例如,用户组A有50个用户,
图1 添加标签 单击“确定”,标签添加完成。系统最多可添加100个标签。 删除标签 标签删除后不可恢复,请谨慎操作。 在“标签管理”页面,单击操作列的“删除”。 在“删除标签”弹窗中,单击“确定”。 批量删除标签 您可以一次选中多个标签,单击页面左上角的删除按钮即可。 图2 批量删除标签
科研机构,从新冠病毒蛋白序列开始,针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化,获取了靶点蛋白的3D结构。并对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,让研究人员可以同时从21个蛋白的角度,综合、无偏地评估药物效果,从而为后
图3 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库模板:使用资产市场订阅的流程时,模板已预置,无需选择数据库模板。 数据库名称:数据库的名称。 输出文件格式:可以将流程生成的分子对接结果,保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking
具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于已获取到的模板使用命令行工具启动分析作业,运行的分析作业将同步显示到EIHealth平台。 获取作业模板 使用health get job -s命令获取启动分析作业的模板,复制并保存模板至本地,您可以保存成.yaml或.txt文件,保存
创建作业 创建作业有以下几种不同的方式,您可以任选其中一种方式。 通过功能模块创建 通过作业中心页面创建 •新建作业 •克隆作业 通过“功能模块”创建 在“功能模块”页面,选择对应的模块,单击“立即使用”。 在具体的功能模块页面,配置相关参数信息。具体参考功能模块章节。 通过“作业中心”页面创建
在云服务订单页面,单击“确认付款”。 购买成功后,可以在“套餐包”页面查看套餐包信息。 资源包到期后,按需资源不会自动关闭,将会以按需付费的方式继续使用。 超出套餐包部分的用量,将会按需收费。 若平台先到期,套餐包还没到期,则不退套餐包剩余的费用。如果平台续费成功后,套餐包可以继续使用。 资源包不能抵扣已经产生的用量。
受体蛋白:受体蛋白文件,支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称:数据库的名称。 输出文件格式:可以将流程生成的分子对接结果,保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking Summary”流程时,保存格式为
务基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源,是一站式的医疗研发平台。EIHealth以开放API的方式提供给用户,您可以根据本文档提供的API来使用服务,支持的全部API请参见API概览。