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前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。
图5 中断后运行作业信息 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行IB驱动自带的MPI应用(3.0.0rc6版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
可以利用公有云的跨地域能力,共享计算资源,海量数据,并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。
在HPC集群上运行社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行社区MPI应用(3.1.1版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
创建SFS Turbo 功能介绍 SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储(NAS),可为云上多个弹性云服务器(Elastic Cloud Server,ECS),容器(CCE&CCI),裸金属服务器(BMS)提供共享访问,能够弹性伸缩至320TB规模,具备高可用性和持久性,
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,关闭ECS防火墙。
前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,关闭ECS防火墙。
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt
应用场景 网络密集型应用,例如存储或者集群计算等,需要网络支持大带宽和低时延特性。RDMA的优势相比其他网络应用程序接口,例如Berkeley接口,就是低时延,低CPU负载和大带宽。RoCE可以比iWARP协议要实现更低的时延。 父主题: 主要概念
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象: dtest/rping打流测试网络双向不通问题:A机器作为Server端,B机器作为Client端,dtest/rping测试RoCE网络异常;调换A、B机器角色,B机器作为Server端,A机器作为Client
在列表中查看当前集群挂载的弹性文件服务,选择待卸载的弹性文件服务,在操作列下单击“卸载”。 单击“确定”,卸载弹性文件服务 父主题: 共享存储