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在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景) 该任务指导以CentOS 7.6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
已成功创建ECS集群,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,添加集群中所有主机的私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群
Bring your own license (BYOL) 磁盘 也称云硬盘,包括系统盘和数据盘。 系统盘 如果镜像未加密,则系统盘也不加密,并在界面上显示“Unencrypted”。如果您选择加密镜像,系统盘会自动加密,具体请参见• 加密涉及的参数(可选配置)。 数据盘 您可以为弹性
报文。 connected模式具有更好的性能,但是会消耗系统更多的内存。多数系统更关注性能,因此大多数场景下IB网口配置为connected模式。 当前版本的网卡驱动不支持connected模式。 由于网卡驱动性能原因,系统关闭了connected模式,因此,当前版本网卡驱动不支持配置connected模式。
命令查看 关闭超线程 系统默认关闭,如果是打开的,需要进行关闭。 判断系统是否开启超线程。 通过查询系统的物理核数和逻辑核数的关系可以判断是否开启多线程,如果:逻辑核数 = 物理核数,说明没有开超线程;逻辑核数 = 2*物理核数,说明系统开启了多线程。 Linux系统可以通过查询/pr
已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP
执行mount -a 备注: 192.168.0.15:/ 是从sfs turbo console中获取到的挂载的路径。 第1个1表示备份文件系统,第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测,0表示不检测,_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过,避免无法挂载主机无法启动。 设置服务开机自启动
购买弹性云服务器 登录管理控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 单击"",选择“计算 > 弹性云服务器”。 单击“购买弹性云服务器”,系统进入购买页后按图1步骤进行操作。 图1 购买弹性云服务器 父主题: 实施步骤
裸金属服务器场景支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(X86
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
04.03r-ce.bin 安装Platform MPI。 # ./platform_mpi-09.01.04.03r-ce.bin 根据系统提示安装Platform MPI,默认安装到“/opt/ibm/platform_mpi”文件夹下。 图1 Platform MPI成功安装
3 通讯库 Ucx:1.6.0 Udapl:2.1.10mlnx 建议从官方网站获取 1 - 4 通用计算增强型弹性云服务器C6h系列 操作系统:CentOS 7.6 规格:c6h.22xlarge.4.physical 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 5 SFS Turbo
已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
/usr/mpi/gcc/openmpi-4.0.2a1/tests/imb/IMB-MPI1 PingPong 图3 集群运行IB驱动自带OpenMPI 系统回显如图3所示,表示集群上运行IB驱动自带的OpenMPI成功。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
优化性能 性能比普通云服务器提高30%。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 HPC与云服务的关系 表1 所需云服务 云服务 作用 弹性云服务器(ECS) 用于在公有云平台上创建高性能计算服务器。 虚拟私有云(VPC)
/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/tests/imb/IMB-MPI1 PingPong 图4 集群运行IB驱动自带OpenMPI 系统回显如图4所示,表示集群上运行IB驱动自带的OpenMPI成功。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景)
Intel MPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Intel MPI应用(l_mpi_2017.3.196版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。