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genomeagent镜像功能点介绍 此章节介绍genomeagent镜像的基本功能。 功能点1：自动生成任务计划、自动生成子步骤代码 功能点2：自动提交EIFlow代码任务 功能点3：报错时自动修正 报错时自动修正 报错时用户介入修正。 功能点4：特定步骤中断（人为or非人为），前序步骤状态继承，重新执行中断步骤
的化学结构，模型参数上亿，是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分子大模型在分子生成、属性预测、生物活性预测和分子优化等20多个药物发现任务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为，进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方
的化学结构，模型参数上亿，是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分子大模型在分子生成、属性预测、生物活性预测和分子优化等20多个药物发现任务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为，进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方
String 作业子任务名称 create_time String 作业子任务运行创建时间 finish_time String 作业子任务运行结束时间 actual_running_time Integer 作业子任务实际运行时间 status String 作业子任务运行状态 sub_tasks
配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件，文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体，默认只处理第一个。 靶点预处理： 去配体：提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷：是否加入离子，使体系电荷守恒，默认是平衡电荷。 蛋白力场：蛋白质力场支持amber03, amber94
Array of TaskDto objects 流程中子任务的描述信息，子任务数量取值范围:[1,64] 数组长度：0 - 64 表4 TaskDto 参数 是否必选 参数类型 描述 task_name 是 String 子任务实际名称，取值范围[1,32]，只能以大小写字母开头，
图1 自动作业 前提条件 在“工具”中完成流程创建。 在“数据库”中完成样本集的数据库创建。数据库的每一行对应一个任务，如果满足触发条件，就会在平台自动运行，并在分析任务列表添加一条记录。 创建自动作业 在“作业”页面左侧，单击“自动作业”页签。 在页面左上角单击“新建自动作业”。
参数类型 描述 task_name String 子任务实际名称 display_name String 流程的子任务展示名称 output_dir String 子任务的输出存放路径 whole_output_dir String 子任务的完整输出路径，查看流程不会返回，查看作业时才会返回完整输出路径
Array of TaskDto objects 流程中子任务的描述信息，子任务数量取值范围:[1,64] 数组长度：0 - 64 表4 TaskDto 参数 是否必选 参数类型 描述 task_name 是 String 子任务实际名称，取值范围[1,32]，只能以大小写字母开头，
大大提升虚拟筛选和分子动力学模拟计算效率。 全平台无需软硬件安装调试成本，开箱即用，随时可用。全平台包括盘古辅助制药赋能药物研发的全链条任务，将新药研发从“马拉松”迈向“加速跑”。 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
收藏夹 收藏夹用于收藏用户的任务结果，通过单击相应的作业名称跳转到作业详情页面，可以收藏大小分子，并在收藏夹中查看。收藏夹内分为小分子和大分子，小分子通常为低分子量的化合物，如蛋白质配体；大分子多为蛋白质靶点。 小分子涉及分子对接、分子优化、靶点口袋分子设计、CPI、分子生成、分子搜索、FEP、聚类详情页。
是否必选 参数类型 描述 task_name 是 String 子任务实际名称，取值范围[1,32]，只能以大小写字母开头，由大小写字母、数字、中划线（-）、下划线（_）组成，以大小写字符或数字结尾。需要和已有子任务的名称一致。 最小长度：1 最大长度：32 inputs 否 Array
参数类型 描述 task_name String 子任务实际名称 display_name String 流程的子任务展示名称 output_dir String 子任务的输出存放路径 whole_output_dir String 子任务的完整输出路径，查看流程不会返回，查看作业时才会返回完整输出路径
obsutil_checkpoint。 每个分段下载任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的down子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或被中断后，下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式，如：*
obsutil_checkpoint。 每个分段上传任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或被中断后，下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --msm -N 否 开启多文件/文件夹上传模式，支持的值：[1
配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容
# 流程中子任务的描述信息，子任务数量取值范围:[1,128] - task_name: app1-1 # 子任务实际名称，取值范围[1,32]，只能以大小写字母开头，由大小
# 流程中子任务的描述信息，子任务数量取值范围:[1,128] - task_name: app1-1 # 子任务实际名称，取值范围[1,32]，只能以大小写字母开头，由大小
obsutil_checkpoint。 每个分段复制任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或被中断后，下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 批量复制时
分段总数，上传的文件总共分成了几个片段 缺省值：1 最小长度：1 最大长度：4 multipart_id 否 String 分段上传任务id，除了第一个片段外，后续的片段都需要标识出任务id 最小长度：1 最大长度：128 file_name 否 String 文件名称 最小长度：1 最大长度：2000
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