NextFlow学习记录--序列比对和评估

在分析NGS数据（fastq格式）之前，需要有参考基因组，bed文件，输入数据这里构建一个流程，分为两步：将fastq比对为sam，并转成bam（需安装bwa或bowtie，还需安装samtools）对bam的某些区域进行测序深度评估，并绘图（需安装gnuplot）首先用人类hg19的

什么是序列？Python序列详解（包括序列类型和常用操作）

网 == 网 序列切片 切片操作是访问序列中元素的另一种方法，它可以访问一定范围内的元素，通过切片操作，可以生成一个新的序列。 序列实现切片操作的语法格式如下： sname[start : end : step] 其中，各个参数的含义分别是： sname：表示序列的名称； st

Python常用的序列化工具对比，看哪个性能最好

hon序列化我们使用python时，经常用到的数据就是int，float，string，list， dict，tuple这些内置的数据类型和结构。写程序时，我们很可能希望把这些基本数据存储到硬盘，即保存存储结果。这个过程，我们称之为“序列化”Python里面常用的序列化工具有：j

序列求和

问题描述：输入一个整数，计算序列之和，例如输入100000000，计算从1+.....+100000000，案例如下：import timen = int(input("输入你要计算的整数之和："))start=time.time() s = n * (n + 1) / 2 #

【JAVA反序列扫描工具】简介、下载、安装、使用

【JAVA反序列扫描工具】简介、下载、安装、使用 ​  目录   一、Java Deserialization Scanner 1.1、简介： 1.2、组成： 二、下载： 2.1、方法一：BAPP store 2.2、 方法二：GitHub 三、配置 3.1、

关于序列化反序列化的实现

我参考了demo中已有的序列化反序列化代码，对整体的实现不太明白。主要包含以下两点具体问题：什么时候使用ar？在data_type.h($DDK/include/inc/hiaiengine/data_type.h)中定义了很多结构体，后面紧跟着序列化，如：Classification {

Atlas500 序列化反序列化函数

500时，需要对传输的数据结构添加序列 化以及反序列化代码。现在参照https://support.huaweicloud.com/api-matrix-atlas500app/atlasmatrix_07_0129.html 进行序列化反序列化函数编写，文档中有不明白的地方，希

【工具使用】常用网络测试工具

会受到缓冲区大小的影响，默认的缓冲区比较小的话，会造成实例到达高pps丢包的现象，因此建议在测试前调整下缓冲区大小 2 mtr参考：MTR工具使用说明与结果分析：https://help.aliyun.com/zh/ecs/use-mtr-and-analyze-the-mtr-

网络传输数据序列化工具Protostuff

一直在物色比较好用的网络传输数据序列化工具，看了诸如marshalling，protobuff等，但是均有一个共同特点，使用起来异常繁杂，有没有比较好用同时性能又不会太差的组件呢？答案当然是有的，那就是基于protobuff改造的protostuff，它拥有良好性能的同时，又免去

GaussDB 100 修改序列

VALUE声明序列的最大值。NOMAXVALUE声明序列无最大值。如果没有声明该子句或者声明了NO MAXVALUE，则使用默认值：递增序列的缺省为 263-1。递减序列的缺省为-1。MINVALUE bigint | NOMINVALUEMINVALUE声明序列的最小值。NOM

GaussDB 100 创建序列

me将要创建的序列名。可以用模式修饰。INCREMENT BY bigint用于指定序列的步长。非零整数。缺省值是1。increment为正数时，将生成一个递增的序列。increment为负数时，将生成一个递减的序列。START WITH bigint用于指定序列的起点。star

MindSpore社区与北大BIOPIC联合发布蛋白质多序列比对开源数据集

例如在AlphaFold2模型中，目标蛋白序列的MSA信息就是预测结构的必要输入信息之一。 数据库建立方法Protein MSA中的目标序列将几乎完全覆盖最新版本（2021.02发布）的UniRef50数据库中的蛋白质序列，而比对序列来自于最新版本的UniClust30数据库。

【数字信号处理】序列分类 ( 单边序列和双边序列 | 有限序列和无限序列 | 稳定序列和不稳定序列 )

文章目录 一、单边序列和双边序列二、有限序列和无限序列三、稳定序列和不稳定序列 一、单边序列和双边序列 单边序列 : 序列 x

【数字信号处理】基本序列 ( 实指数序列 | 收敛序列 | 发散序列 )

文章目录 一、实指数序列 一、实指数序列 实指数序列 : x

基于二代测序的序列比对的文件格式和含义

仪得到的序列文件格式，大多数测序仪生成的序列格式为FASTQ， 也有一些是BAM格式的。这里主要讲一下FASTQ格式（如图）：一个fastq文件中可能有几百万条序列，以上这张图片中只展示了三条序列，每条序列占了四行。第一条序列的ID是FP1LH:08681:03840序列的碱基排

SpringBoot下用Kyro作为Redis序列化工具

本篇概览 有时候我们需要将Java对象实例存入Redis，常用方法有两种： 将对象序列化成字符串后存入Redis； 将对象序列化成byte数组后存入Redis； 本章实战上述第二种方式，并且序列化工具选择了Kyro，为了便于开发和验证，将代码写在一个基于SpringBoot的web工程中；

opengauss 常用工具

的针对gs_dump导出数据的导入工具。通过此工具可由gs_dump生成的导出文件进行导入。gs_restore工具由操作系统用户omm执行。-d 连接数据库dbname 并直接将数据导入到该数据库中-s 只导入模式定义，不导入数据，当前的序列值也不会被导入-e 当发送SQL语句

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