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流程说明 分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 EIHealth中的流程由应用搭建形成，应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义，包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。
Report 原始测序数据的质控报告，以HTML文件形式展示。 输出 BamQC Report 测序比对数据的质量控制报告，以HTML文件的形式展示。 输出 VCF 样本的突变信息，包含有SNP和INDEL信息，以VCF的格式存储。 输出 VCF Report 样本突变信息的质量控制报告，以HTML文件的形式展示。
单击“新建”，在新建作业页面选择对应的模块。 图1 新建作业 单击“确定”，在对应的模块页面配置详细信息，具体请参考功能模块。 克隆作业 克隆已有的作业，作业的参数及流程一并克隆到新作业中。 在“作业中心”页面，单击作业操作列的“克隆”。 在作业详情页面修改对应的参数信息。 参数确认无误后，单击“提交”按钮。
resource_id 是 String 收藏的资源ID。 最小长度：1 最大长度：128 resource_name 是 String 收藏的资源名称，正则匹配中文，英文字母和数字及下划线。 最小长度：1 最大长度：128 resource_type 是 String 收藏的资源类型，正则匹配英文字母和数字及下划线。
导出作业 使用export命令导出作业信息。 导出的作业信息会以zip文件格式保存到当前目录，zip文件中包含以下两个文件： jobDetails.zip：保存job的yaml文件 jobInfo.csv：保存job信息 命令结构 # 使用job-id导出作业 health export
上传流程 通过在本地修改流程的yaml模板，上传流程至项目中。 获取流程yaml模板。 单击“上传流程”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get workflow -s命令获取创建流程的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或
归档存储的费用为单独计费。 删除原数据 是否删除原数据。如果选择删除原数据，系统会在归档完成后统一删除已归档数据。归档后的数据可在归档中心查看或恢复。 在归档过程中请不要对归档的文件或者文件夹进行添加、更改操作，以免造成您的数据损失。 选择归档数据 选择该项目下需要归档的数据。 单击“确认”，进行归档。
步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 在作业列表中，单击对应的作业名称，可查看作业运行状态，运行时间等信息。 图13 作业运行状态 单击具体的每个应用，可以查看每个应用的运行信息：输入输出，节点参数，应用以及日志等信息。 单击具体的输出参数便可跳转到具体的文件位置。 图14 查看应用信息 图15 查看输入、输出数据位置
导入应用”的方法，导入至自己的项目中使用。 流程 EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。 分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。
通过设置商标您可以自定义平台Logo和标语。设置商标功能只有管理员用户可进行操作。 在平台右上角用户名中选择“设置商标”，设置平台Logo和标语。首次修改时，需同时修改商标和标题。 图1 设置商标 父主题： 系统设置
如果在创建和追加数据库的过程，显示资源不足，需要扩容CSS集群。 若CSS集群显示“不可绑定”。 检查购买的CSS资源状态是不是正常的。 检查购买的CSS资源是不是绑定了公网IP。 已绑定的集群修改了密码或者公网IP。 在平台侧需要解绑并重新绑定。 CSS资源到期。 在云搜索服务的集群管理列
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 状态码：
上传应用 通过在本地修改应用的yaml模板，上传应用至项目中。 获取应用yaml模板。 单击“上传应用”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get app -s命令获取创建应用的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.tx
设置邮箱消息的接收范围和接收类型。 接收范围 仅自己接收操作：自己所执行的操作。如果选择此项，接收类型默认全选。 全部接收：自己有权限访问的项目中产生的操作，包含自己和其他项目成员所执行的操作。默认为全部接收。 不接收：不接收操作通知。 接收类型 数据操作：数据的复制、删除、导入等异步操作通知。
列的名称不可以和PostgreSQL 11版本的关键字冲突。 是否主键 主键用于唯一地标识数据表中的信息，可通过设置复合主键将数据表中的多个数据设置为唯一，主键至多设置10个。 允许为空 主键所包含的列不允许设置为空。当数据库中某些数据允许没有值时，可设置为空。 是否可查询 依据模板中定义的列信息，给出数据库中
平台通过云审计服务（CTS）提供操作记录的收集、存储和查询，审计操作可以设置导出用户的写操作（默认）和读操作（可选），保存周期可以设置需要保存的审计日志的保存周期，下载按钮可以下载最近7天内最新的1万条数据审计日志，查看按钮可以查看及下载保存的审计日志。 通过审计日志可用于支撑安全
输入已添加至平台的用户的全称。 图5 输入用户名全称 单击“添加”，设置用户角色。详细成员角色介绍请参见表1。 图6 设置成员角色 单击“确认”，将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 操作步骤 单击项目名称，进入项目“设置”页。 单击“操作”列“修改”，重新设置项目成员的角色。 详
取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig，根据contig下发对应的任务，并依据不同任务，指定并行下发的任务数，以降低流程整体的运行时间。 流程执行信息 NGS流程由fastp、bwa-mem、
平台支持导入其他项目的模板，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”，预置的模板不支持导入。 在左侧导航栏选择“模板”页签，单击“导入模板”。 导入方式选择“项目”，选择项目名称，勾选需要导入的模板，可以在“导入模板名称”中修改模板名称，单击“确定”。 图1 从其他项目导入模板
以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 存在一个创建好的项目。 单击项目名称后面，进入项目设置页。
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