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基本概念 应用 医疗智能体应用是生物信息软件的镜像封装，应用既可以独立使用，也可以将多个应用编排入流程串联使用。用户可以制作自定义应用，创建分析流程。 流程 医疗智能体流程包含基因组学分析过程所需应用的执行先后信息以及数据输入输出等定义。分析流程由至少一个应用组成，流程中的各个应
--exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待复
--exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待上
Turbo加速，在投递作业时可以选择“IO加速”。 降低通量运行，进而降低带宽、IO需求，使得带宽、IO满足生产需求。 优化软件算法，如使用内存做缓存等，降低软件的IO需求。 针对特定的项目，对带宽或IO性能进行扩容。 提交工单或联系服务技术支持。 父主题： 流程、作业
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
制作镜像。 【可选】根据网络情况，配置基础镜像中的PyPi Mirror，对下载进行加速。基础镜像中的PyPi Mirror，默认配置为华为云软件开发云的PyPi mirror。您可以在容器中执行如下命令，查看PyPi Mirror。如果您想用其他PyPi Mirror，可将命令中的
选择CPU、GPU类型和大小，选择内存大小，内存单位为GB。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型，以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如，GATK是基于X86指令集开发的生信软件，使用CentOS的X86系统创建GATK镜像，则在创建应用时选择“X86”。 CPU需求：请按实际需求填写，取值范围为“0
以引用数据库。 镜像管理 您可以使用该工具对镜像执行标记、上传、下载、查询、导入、更新和删除标签等操作。 应用管理 应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 您可以使用该工具创建应用，并进行修改、删除、查询、导入操作。 流程管理 流程包含分析过程中所需应用的执
"conda_py37" 使用新生成的Notebook kernel。 在Files页面，选择新建的Notebook kernel。 安装新软件包。 查看pandas是否安装。如下表示 pandas未安装。 返回Terminal，切换到相应的环境“py37”，然后安装pandas。
同步文件夹时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含文件的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待上
、Markdown等），以页签形式展示。 JupyterLab的一大优点是，可以任意排版多个文件。在右侧文件展示区，您可以拖动打开文件，随意调整文件展示位置，可以同时打开多个文件。 图8 多文件任意编排 当在一个Notebook中写代码时，如果需要实时同步编辑文件并查看执行结果，可以新建该文件的多个视图。
基于Res-VAE和表达谱对单细胞数据降维 使用该Notebook时需要运行相应的代码模块，运行步骤如下所示。 环境配置：加载AutoGenome以及辅助绘图的软件包。 读取配置文件：通过json文件配置输入和输出路径。 模型训练：针对提供的数据和模型参数，AutoGenome会搜索得到最优的神经网络
-x 否 不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。批量移动时该参数可选。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符。例如，abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待
GEneration）是由北京大学高毅勤教授课题组与华为团队联合开发的新一代分子动力学模拟程序，具有高性能、模块化等特性，是一个完全自主研发的分子模拟软件库。基于高毅勤教授课题组和华为团队的技术支持，已经实现自由能微扰加速10倍以上。测试 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
GEneration）是由北京大学高毅勤教授课题组与华为团队联合开发的新一代分子动力学模拟程序，具有高性能、模块化等特性，是一个完全自主研发的分子模拟软件库。基于高毅勤教授课题组和华为团队的技术支持，已经实现自由能微扰加速10倍以上。 父主题： 盘古辅助制药平台
流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用，并将其编排调度，形成自定义分析流程。 同时集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。
收藏资产 公共资产列表 表1 资产列表 分类 资产名称 说明 镜像 image-stitching 针对TB级3D鼠脑稀疏标记成像数据的全自动拼接软件，减少数据分析50%的错误率，节省20%的时间，助力脑科学研究的效率提升。 AutoGenome AutoGenome为Notebook镜
创建容器应用基本流程 快速创建一个kubernetes集群 04 使用 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用，并将其编排调度，形成自定义分析流程。 准备工作 1. 购买服务 2. 获取认证信息 3. 下载命令行工具 4. 命令行工具初始化
参数类型 描述 mobile 否 String 用户手机号，纯数字，长度小于等于32位，当且仅当重置手机号时传入空串。必须与国家码同时存在。 最小长度：0 最大长度：32 areacode 否 String 国家码，当且仅当重置手机号时传入空串。中国大陆为“0086” 最小长度：0 最大长度：10
单击应用图标，弹出编辑图标，单击按钮，设置应用参数。 在“高级参数”下面可以设置加速类型。如果作业加速类型选择“无”，task加速类型可以任意选择。如果作业加速类型选择IO加速或者本地盘加速，则此处task加速类型无法设置。 参数确认无误后，单击页面上方“启动作业”按钮，可以直接基于该流程创建自动分析作业。
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