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不再显示此消息
在平台右上角用户名中选择“个人设置”,进入邮箱消息通知设置页面。设置邮箱消息的接收范围和接收类型。 接收范围 仅自己接收操作:自己所执行的操作。如果选择此项,接收类型默认全选。 全部接收:自己有权限访问的项目中产生的操作,包含自己和其他项目成员所执行的操作。默认为全部接收。 不接收:不接收操作通知。
在EIHealth开发环境Notebook中使用命令行工具时,请依据以下步骤配置代理。 打开Notebook,并选择Terminal,打开Notebook的命令行界面。 执行以下命令下载命令行工具,并获取配置Notebook代理所需的域名和端口信息。 示例中下载的版本为Linux ARM 64位。 wget
用来指明容器内进程对外开放的端口,多个端口之间使用空格隔开。运行容器时,通过参数-P(大写)即可将EXPOSE里所指定的端口映射到主机上另外的随机端口,其他容器或主机就可以通过映射后的端口与此容器通信。您也可以通过-p(小写)参数将Dockerfile中EXPOSE中没有列出的端口设置成公开的。
资源被临时移动。 303 See Other 查看其它地址,使用GET和POST请求查看。 304 Not Modified 所请求的资源未修改,服务器返回此状态码时,不会返回任何资源。 305 Use Proxy 所请求的资源必须通过代理访问。 306 Unused 已经被废弃的HTTP状态码。
--log-path -l 否 日志路径,不填写时默认为命令行工具当前路径下healthcli.log文件。 --http-proxy -p 否 HTTP代理配置,格式为“http://username:password@your-proxy:your-port”。 --swr-endpoint
最大长度:128 email 是 String 邮箱 最小长度:1 最大长度:128 language 是 String 语言,只支持en_us和zh_cn 枚举值: en_us zh_cn 响应参数 无 请求示例 邮箱连通性测试, 输入服务器ip、用户名、密码、邮箱地址、语言 https://eihealth
安装容器引擎 容器引擎是一个开源的引擎,可以轻松的为任何应用创建一个轻量级的、可移植的、自给自足的容器。 容器引擎几乎支持在所有操作系统上安装,用户可以根据需要选择要安装的容器引擎版本。请使用自己的电脑搭建Docker环境,或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。
务实例详情(默认json格式)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取json格式实例详情 health
install -y java #使用&&拼接命令 RUN touch test.txt && echo "abc" >>abc.txt #对外暴露端口 EXPOSE 80 8080 1038 #复制文件 COPY abc.txt /opt/ #复制文件夹 COPY /webapp /opt/webapp
配额管理 为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”,查看配额。 图1 配额管理 父主题: 用户指南(基因平台)
建应用”。 填写应用的基本信息。 “名称”填写fastqc,“版本”填写v0.11.5.2。“短描述”、“描述”、“标签”可选填。 图2 填写基本信息 选择镜像。 单击“选择镜像”,在“自定义镜像”列表中选择fastqc镜像和镜像版本。 依据FastQC命令说明填写镜像启动命令。
新建应用 填写应用的基本信息。 “名称”填写fastqc,“版本”填写v0.11.5.2。“图标”、“标签”、“短描述”、“描述”可选填。 图3 填写基本信息 选择镜像。 单击“选择镜像”,在“自定义镜像”列表中选择fastqc镜像和镜像版本。 依据FastQC命令说明填写镜像启动命令。
流程”页签,单击NGS流程行的“启动作业”。 请参考配置输入和依赖数据章节,设置NGS流程数输入数据。 在新建作业页面,填写作业信息。 基本信息:包含作业名称、标签、描述。 输出路径:存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。 不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。
自定义镜像创建Notebook样例 Notebook提供了在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码,在创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像。同时,您也可以使用自定义镜像,创建Notebook,满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Noteboo
参数说明填写信息。 图1 创建Notebook 表1 参数说明 参数名称 说明 名称 Notebook的名称。名称长度1-63,仅支持小写字母、数字、中划线(-),开始只能是小写字母,结束只能是小写字母或数字。 描述 Notebook的简要描述。 镜像类型 支持系统镜像和自定义镜像。
notebook-id 无 否 notebook id,不填写时表示获取notebook列表,填写时表示获取notebook详情。 --url -u 否 获取打开notebook的地址。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Wind
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。模板修改好后,再使用命令行工具上传模板,创建应用。 修改模板时,需填写镜像地址,获取方法请参见获取镜像地址。镜像制作和上传方法请参见镜像管理和创建FastQC应用样例。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name:
路径在新建流程和运行分析作业时可指定。 新建流程 单击“新建流程”,进入流程设计器页面。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具,详细介绍请参见流程设计器。新建流程时,自动保存默认打开。 图1 新建流程 填写流程参数信息,填写完成后单击“确定”。 填写流程基本参数,
新列,并且列名可搜索。 图3 定义触发器 填写作业参数配置。填写完成后,单击“下一步:设置流程参数”。 作业名称:可选择“数据库表”、“自定义”或“自动生成”。 标签:设置作业标签。 描述:根据需要填写。 输出路径:可选择“数据库表”和“自定义”。选择“自定义”时,存放输出结果的
详细的创建应用过程、镜像填写方法、参数填写方法,请参考创建应用样例章节。 单击“新建应用”,进入新建应用页面。 图1 新建应用 填写应用的基本信息,包括“名称”、“版本”、“图标”、“标签”、“短描述”和“描述”。 图2 基本信息 选择镜像和镜像版本。 详细的镜像介绍和制作方法请参见镜像管理。