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分子合成路径规划任务（MSP） 新建分子合成路径规划任务接口 查询分子合成路径规划任务 父主题： API（AI辅助药物设计）
分子合成路径规划作业管理 创建分子合成路径规划作业 查询分子合成路径规划作业详情 父主题： API（盘古辅助制药平台）
创建分子合成路径规划作业 功能介绍 创建分子合成路径规划作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/synthesis 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述
合成路径规划 合成路径规划基于盘古药物分子大模型，根据给定的目标分子，可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件：支持S
201 分子合成路径规划成功提交响应，返回分子合成路径规划任务ID { "text/plain" : "87ba6b54-2288-4a5d-90a2-3db01c22a9d2" } 状态码 状态码 描述 201 分子合成路径规划成功提交响应，返回分子合成路径规划任务ID 错误码
查询分子合成路径规划任务 功能介绍 通过分子合成路径规划任务ID查询分子合成路径规划任务状态及结果。 URI GET /v1/{project_id}/task/synthesis/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String
查询分子合成路径规划作业详情 功能介绍 查询分子合成路径规划作业详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/synthesis/{job_id} 表1 路径参数 参数
查看详情：单击查看详情，跳转至分子详情页进行查看。 查看3D：查看分子的3D视图。 下游分析：靶点口袋分子设计对应的下游分析为分子优化、自由能微扰、合成路径规划和分子搜索，单击“确定”即可创建。 下载3D：如果分子设置了靶点，可以单击“下载3D”下载优化后的小分子或者复合物，如果分子未设置靶点，单
API（AI辅助药物设计） 分子生成（MG） 分子优化（MO） 靶点化合物结合预测（CPI） 分子属性预测（MPP） 分子搜索（MS） 分子合成路径规划任务（MSP） 自定义属性任务（MCP）
先导化合物优化 分子优化 靶点口袋分子设计 自由能微扰 合成路径规划 父主题： 功能模块
择。 先导化合物优化 在先导化合物优化阶段，提供分子优化、靶点口袋分子设计（骨架跃迁、片段优化、片段连接、片段生成）、自由能微扰、合成路径规划功能。 模型管理 支持客户用自己的数据进行模型训练、对模型进行管理以及在平台上用自己的模型进行分析。 父主题： 盘古辅助制药平台
情”、“下游分析””。 查看详情：单击查看详情，跳转至分子列表页进行查看。 下游分析：分子优化对应的下游分析为分子优化、分子搜索和合成路径规划，单击“确定”即可创建。 每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数QED、SaScore QED：代表分子的成药性。 SaScore：
选，排序等功能。每个小分子支持“查看详情”可以进入小分子的属性详情页；支持“下游分析”，可以进行分子属性预测、分子搜索、分子优化、合成路径规划分析。支持收藏功能，单击按钮，即可收藏CPI预测结果，收藏后可直接在收藏夹页查看。 图5 查看结果（2） 图6 查看结果（3） 查看作业信息页面。
药物筛选、疫苗设计与药物研发等工作中发挥着不可替代的基础性的作用；也将支撑病毒溯源、变异进化、致病机理等研究工作。华为云联合多家科研单位，推出基因组自动化鉴定云平台。该平台直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据，具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能，实现了对样本中
分子对接 分子对接基于华为云大算力，可根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构，计算对接结合能，实现百万级别虚拟筛选。 单击“分子对接”功能卡片，进入分子对接受体预处理页面，单击上传受体文件，进行受体蛋白预处理配置。 受体文件仅支持PDB格式，若文件中存在多个受体，默认只处理第一个。受
结构。 选择参考配体：当前自由能微扰支持自动规划路径，选择参考配体后系统自动计算，用户也可自主添加或删除配体对。 图1 上传文件 引用外部桶时，需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”，选择配体对。 页面显示：正在规划自动路径，您也可以直接选择配体对后进行下一步。
put。 不填写路径时，默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级：运行优先级，分为0~9级，优先级高的作业会被优先执行（该特性规划中，暂未上线）。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，
API（盘古辅助制药平台） CSS集群管理 药物通用接口 药物数据库管理 药物作业管理 自由能微扰作业管理 分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI作业管理
作业管理简介 在作业中心页面，可以创建分子对接、分子优化、自由能微扰、合成路径规划功能的作业。 在“作业中心”页面，以列表形式展示了项目中作业的运行状态。您可以查看作业的名称、创建时间、运行状态、总时长、运行时长、已运行时间、预计还需时间。对于列表中的作业，支持通过作业名称、状态
语言，它能够很好的管理生信流程，并且将其与Conda、Docker、Singularity结合起来使用，可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移，并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的程序模型，因此不用自己去写复杂的并行化的程序，只需要关注“数据流
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