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务的桶。 若设置了该参数,必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息,具体可参考更新配置文件。复制时源桶对应的配置信息为配置文件中的:akCrr/skCrr/tokenCrr/endpointCrr,目标桶对应的配置信息为配置文件中的:ak/sk/token/endpoint。
启动作业 通过使用create或 submit命令引用本地的配置文件,启动分析作业。 命令结构 health create job [flags] # create和submit作用相同 health submit job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明
描述:参数描述,此参数为非必填项。 操作:可以单击操作列“删除”,删除对应的参数。 图2 配置流程参数 参数配置完成后,单击“保存”。 流程创建成功后,单击“保存并启动作业”,或者在流程管理页面,单击流程列表操作列的“启动作业”进入作业设置页面,配置作业的相关信息,具体可参考新建作业。 父主题: Nextflow
式(此时Cell中有光标,可以进行代码编写)。在命令模式下,按下“Enter”键或者鼠标单击代码框可以进入编辑模式。在编辑模式下,按下“ESC”键或者鼠标单击代码框左侧区域即可进入命令模式。 删除文件或文件夹 如果需要在Notebook中删除文件或文件夹,您可以在“Files”列
购买计算资源 删除计算资源节点 修改计算资源 修改性能加速资源 查询消息及已完成作业保留设置 修改消息及已完成作业保留配置 获取供应商logo和名称设置 修改供应商logo和名称配置 获取系统配额信息 获取消息中心消息列表
task输出子目录,默认为空时,自动生成task-name子目录,允许在workflow中配置 inputs: # 输入参数配置,默认覆盖workflow、app中同名配置 - name: 'input_name1'
com/eihealth/admet:2.0.0' } 暂不支持用户设置部分Nextflow配置项 对于dag, timeline, report,,trace配置,医疗智能体(EIHealth)平台会默认开启并且指定相关路径,会覆盖用户侧配置,可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www
分子生成基于盘古药物分子大模型,对初始数据集进行采样,多目标、多方向的快速生成新颖且与靶点蛋白亲和力高的化合物。 单击“分子生成”功能卡片,进入配置页面。 输入初始数据集,有两种输入方式: 选择文件:支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件;小分子支持10-10000个。如果没有初
传受体文件,进行受体蛋白预处理配置。 受体文件仅支持PDB格式,若文件中存在多个受体,默认只处理第一个。受体文件支持上传1个或者多个文件,最多支持输入20个受体文件,文件来源包含数据中心、PDB库、示例数据。 图1 上传受体文件 受体预处理参数配置。 去水:去掉受体蛋白里面的水分子。
登录盘古辅助制药平台。 单击“进入平台”,进入药物平台操作页面。 单击“功能模块 > 苗头化合物发现 > 分子对接模块”,进入分子对接配置页面。 根据分子对接章节完成参数配置。 分子对接任务完成后,单击“作业中心 > 作业名称”,进入作业在输出结果页面查看。 图1 查看分子对接结果 在输出结果
下载单个对象时可指定的对象版本号。 --ps -s 否 每个分段下载任务的段大小,单位:字节,默认为配置文件中的defaultPartSize。 支持带容量单位配置,例如,配置1MB代表1048576字节。支持配置为auto,此时obsutil会根据源对象大小自动设置每个分段任务的段大小。 --cpd
-s 否 每个分段移动任务的段大小,单位:字节,取值范围是100KB~5GB,默认为配置文件中的defaultPartSize。 支持带容量单位配置,例如,配置1MB代表1048576字节。支持配置为auto,此时obsutil会根据源对象大小自动设置每个分段任务的段大小。 --cpd
基于Res-VAE和表达谱对单细胞数据降维 使用该Notebook时需要运行相应的代码模块,运行步骤如下所示。 环境配置:加载AutoGenome以及辅助绘图的软件包。 读取配置文件:通过json文件配置输入和输出路径。 模型训练:针对提供的数据和模型参数,AutoGenome会搜索得到最优的神经网
排查思路、解决方法请参考查看执行结果章节的说明。 场景4 参数配置的不合理导致的作业执行失败。 解决方法 选择运行失败的分析作业,单击操作列“更多>重试”。 在弹出的提示框中选择“更改参数”。 图6 更改参数 在作业配置页面,修改相关参数后,单击页面右上角的“重试作业”。 图7 重试作业
failed}_report_时间_TaskId.txt。单个结果清单文件默认情况下最大为30MB且最大可保留的文件个数为1024,可在配置文件中通过recordMaxLogSize和recordBackups分别配置。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。
助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置,可创建平台的子用户,并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置,以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组,以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详
-s 否 每个分段上传任务的段大小,单位:字节,取值范围是100KB~5GB,默认为配置文件中的defaultPartSize。 支持带容量单位配置,例如,配置1MB代表1048576字节。 支持配置为auto,此时obsutil会根据源对象大小自动设置每个分段任务的段大小。 --cpd
查看节点执行规则 图7 查看节点伸缩历史 图8 查看关联节点列表 配置缩容策略 缩容策略只支持统一配置,且不会对手动购买的计算资源节点缩容。 在平台右上角用户名中选择“系统资源>计算资源>节点伸缩策略”。 单击“配置缩容策略”。 图9 配置缩容策略 表2 缩容策略参数说明 参数 说明 空置时间
应用管理命令 应用配置文件说明 创建应用 修改应用 查询应用 删除应用 导入应用
对于执行失败的作业,鼠标点击作业状态,在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。 作业相关信息 在详情页可以查看作业执行命令、配置参数、流程配置文件、执行日志、报告信息。 图1 作业相关信息 Tasks相关信息 在详情页可以查看每个Tasks的相关信息。单击每个task可以打