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status_list 否 Array 作业运行状态列表, 支持WAITING|RUNNING|FINISHED|FAILED|CANCELLED。 数组长度:0 - 10 type_list 否 Array 作业类型列表, 支持DOCKING|OPTIMIZATION|SYNTHES
“数据”页面上传 通过“数据”页面上传数据,支持上传最大为1GB的单个文件。 数据上传方法请参见“数据”页面上传。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealth平台,提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用,支持上传最大为48.8TB的单个文件。
称相同。发布成功的流程不支持修改展示名称。 版本 发布流程的版本。 版本长度必须为1-24个字符,以字母或数字开头(多个字符可以连续),中间只能包含-.特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。 类型 流程。 标签 设置发布流程的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的流程设置的简要描述。
批量执行NGS分析 对于测序得到的大量数据,批量并自动执行NGS分析是提高工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出,图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验,但是当面临大批量的测序数据时,需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率,本章节
称相同。发布成功的应用不支持修改展示名称。 版本 发布应用的版本。 版本长度必须为1-24个字符,以字母或数字开头(多个字符可以连续),中间只能包含-.特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。 类型 应用。 标签 设置发布应用的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的应用设置的简要描述。
聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook的详细操作指导,请参见Jupyter Notebook使用文档。 支持的AI引擎 Notebook提供的AI引擎是Python 3,适配CPU/GPU芯片。 父主题: 开发环境(Notebook)
前需要先购买性能加速。 本地盘加速:使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时,需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速,使用OBS桶中数据用于本地盘加速,可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶 作业信息填写完成后
String 文件来源,支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度:1 最大长度:8 url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。
除的核心项目,将进入“待删除项目”列表中。待删除项目会保留7天,6天内您可以将项目恢复成可用状态,最后一天不支持恢复。7天后,项目将自动删除,删除后不可恢复。非核心项目支持立即删除。 图5 项目状态 父主题: 项目管理
件快速的定制并行执行的样本数目,大大节约了生信人员搭建组学分析流程的时间。 医疗智能体(EIHealth)平台集成了Nextflow框架,支持用户直接在医疗智能体(EIHealth)平台安装Nextflow。 父主题: Nextflow
满足生产需求。 优化软件算法,如使用内存做缓存等,降低软件的IO需求。 针对特定的项目,对带宽或IO性能进行扩容。 提交工单或联系服务技术支持。 父主题: 流程、作业
<retention-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 retention-name 无 是 名称,支持message或者completed-jobs。 --number -n 否 保存条数,范围:10000-10000000。 命令示例 本
查询作业 功能描述 查询指定job详情。 命令结构 health nextflow get job ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 job id,不指定job-id时,列出当前project的全部job的基本信息。 --type
址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data 否 String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0
member-name 无 是 用户名称。 --project -p 否 项目名称,不填时默认为当前所在项目。 --role -r 是 用户项目角色,只支持Administrator,Developer,Uploader或者Viewer。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth
member-name 无 是 用户名称。 --project -p 否 项目名称,不填时默认为当前所在项目。 --role -r 是 用户项目角色,只支持Administrator,Developer,Uploader或者Viewer。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth
object 受体文件 engine String 对接引擎,支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值:AUTODOCK_VINA 最小长度:0 最大长度:15 docking_type String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。
表10 EditedLigand 参数 参数类型 描述 source String 文件来源,仅支持RAW。 最小长度:1 最大长度:6 format String 文件格式,仅支持CIF。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。
计算结果等。 容器镜像服务(SWR) 容器镜像服务(Software Repository for Container,简称SWR)是一种支持镜像全生命周期管理的服务,提供简单易用、安全可靠的镜像管理功能,帮助您快速部署容器化服务。 医疗智能体使用SWR存储工具镜像,包括内置工具及自定义工具的存储。
object 受体文件。 engine String 对接引擎,支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值:AUTODOCK_VINA 最小长度:0 最大长度:15 docking_type String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。