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图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook Notebook列表中所有文件的读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作,即Notebook中的数据和被挂载的OBS路径中的数据是同步的。在OBS路径中创建文件夹、上传数据,会同步到Notebook中,Notebook中的操作也会同步到OBS中,如图
--domain-name -d 是 与管理员(购买平台的账户)的账号名一致。 --user-name -u 是 子用户的用户名。 管理员(购买平台的账户)登录时,user-name和domain-name一致。 --password -w 是 密码。 --ak -a 是 AK(Access Key
创建FastQC应用样例 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例,帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检测工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直接使用
如何将生物信息学软件封装为镜像并上传 本章节提供了在EIHealth平台创建FastQC应用的样例,帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检查工具,此样例基于开源的FastQC软件,将软件制作成镜像,上传至平台,并基于此镜像创建应用。应用创建完成后可以直
import file lmx-test-01:/lmx-database/data1.txt 2021-02-01 11:11:27 Import row 2-4 of file lmx-test-01:/lmx-database/data1.txt 下载数据作业执行日志 health
管理员用户包含子管理员,均具备删除权限。但子管理员不可将管理员删除。删除用户只能删除来源为本平台的用户,如果来源为IAM,则只支持移除。 项目是存储数据、镜像、分析作业等的工作空间,执行删除用户操作时,只有在该用户名下没有项目时,才可以被删除。在用户的操作列,单击“删除”,删除对应的用户。
同步:命令执行完成后,保证本地源路径是OBS指定目标桶的子集,即本地源路径下的所有文件均能在OBS指定目标桶中找到对应对象。 命令结构 health sync <src> <dest> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 src 无 是 被同步的目录或文件。 destdir
CANCELLED lmx-test-01 2021-02-01 11:11:27 lmx-database-01 data DATABASE_IMPORT xxx PROCESSING lmx-test-01 2021-02-01
basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 作业基本信息。 file 是 ClusteringDrugFile object 分子文件。 表4 CreateDrugJobBasicInfo 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String
基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。 基础编程语言类镜像,如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。
几种不同类型的归档,区别是什么 标准存储 标准存储访问时延低和吞吐量高,因而适用于有大量热点文件(平均一个月多次)或小文件(小于1MB),且需要频繁访问数据的业务场景。 适合高性能,高可靠,高可用,频繁访问场景。 归档存储 归档存储适用于很少访问(平均一年访问一次)数据的业务场景
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
命令结构 health create label [name] [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 name 不涉及 是 标签名。 description -d 否 标签描述。 命令示例 health create label name -d xxx {
关键概念 盘古药物分子大模型 盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分子大
基本概念 盘古药物分子大模型 盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分子大
参数名称:fastq-file1 数据类型:File 必传:是 参数2 参数名称:fastq-file2 数据类型:File 必传:是 参数1 参数名称:sample-id 数据类型:String 必传:是 参数2 参数名称:seq-platform 数据类型:String 必传:是 参数3 参数名称:fq-file1
单击“下一步”,选择配体对。 页面显示:正在规划自动路径,您也可以直接选择配体对后进行下一步。 待计算路径:选择待计算的路径。待计算路径起点是中心配体名称,终点是其他配体的名称。在相似度计算完成之前默认未勾选。您也可以添加路径或者重置路径。添加路径和重置路径可以通过单击右边的“添加路径”或者
i 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型
OBS存储类型的Notebook 在创建Notebook时,如果“存储配置”选择的是“OBS”。Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作,即Notebook中的数据和OBS中的数据是同步的。在OBS路径中创建文件夹、上传数据,会同步到Notebook中,N
参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1