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约束限制 当前Nextflow相关特性仅为公测版本,部分功能暂不支持,因此存在如下限制约束。 流程使用的镜像和数据需要按照医疗智能体(EIHealth)平台的规范进行上传 推荐通过eihealth-toolkit进行上传。eihealth-toolkit介绍详见什么是医疗智能体e
- 5 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布镜像,指定资产形成为demo-image,版本号为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4
只有当应用的输入、输出参数类型相同时,才可以进行连接。例如,将app1和app2链接起来,app1的输出,app2的输入均为file类型。 单击应用图标,弹出编辑、删除、复制图标,可对应用执行相应操作。 图5 编辑应用 单击按钮,进入参数设置页面,可查看修改参数。 名称:应用的原始名称。 版本:应用版本。
理和使用。 操作步骤 下载命令行工具。 安装命令行工具。 本示例中以Windows系统为例,介绍安装命令行工具的方法。 下载Windows版本的客户端,得到health.exe文件,health文件无需安装,放置在任一文件夹中即可。 图1 下载命令行工具 使用win键+R,输入c
响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布数据资产,数据资产名称为eihealth-asset,版本为1。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
标记镜像 使用health docker tag命令给待上传的镜像打标签。 执行镜像相关命令,请在本地搭建Docker环境,要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。 默认标记到当前所在项目,需先使用切换项目命令进入想要上传镜像的项目。 命令结构 health docker tag
Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 否 String 应用名称 最小长度:1 最大长度:56 version 否 String 应用版本 最小长度:1 最大长度:32 请求参数 表3 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
表7 DeleteTagRsp 参数 参数类型 描述 tag String 镜像tag名称 status String 删除结果 failed_reason String 失败原因 请求示例 批量删除镜像版本,删除v1.0,v2.0版本 https://eihealth.cn-north-4
最大长度:2000 version 是 String 版本号 最小长度:1 最大长度:128 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 订阅资产市场数据,资产数据版本为v1.0,使用覆盖模式,目的目录为test。
修改应用 使用edit或update命令修改应用的内容,应用的名称和版本不支持修改。 命令结构 health edit app ID [flags] # edit和update作用相同 health update app ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选
镜像简介 由于生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。 将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台的镜像管理
所有者”或“管理员”。 单击项目名称,进入所选项目,并选择“镜像”,进入镜像管理页面。 单击“镜像导入”。并选择镜像所在的项目、镜像和镜像版本。 图1 镜像导入 单击“确定”,完成镜像导入。 从其他项目导入的镜像,在镜像列表“源项目”列中,显示所属的项目。 客户端上传镜像 使用命
镜像管理简介 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台的镜像管理,
参数 是否必选 参数类型 描述 asset_id 是 String 镜像资产ID 最小长度:1 最大长度:128 version 是 String 镜像资产版本 最小长度:1 最大长度:128 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String
华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 tag 是 String 镜像版本名称 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在
镜像 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台的镜像管理,
Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 否 String 流程名称 最小长度:1 最大长度:56 version 否 String 流程版本 最小长度:1 最大长度:24 请求参数 表3 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
是否必选 参数类型 描述 type 否 String 镜像类型 name 否 String 镜像名称 最小长度:1 最大长度:128 show_empty 否 Boolean 是否展示无镜像版本的镜像 缺省值:true 请求参数 表3 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述
n。 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 作业id max_platform_flavor TaskResourceDto object 平台节点最大规格 app_infos Array of AppFilterDto objects
Notebook中安装 例如,通过Jupyter Notebook在“TensorFlow-1.8”的环境中安装Shapely。 打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中,选择“New”(新建),然后选择“TensorFlow-1.8”。 在新建的Notobook中,在代码输入栏输入如下命令。