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单击ngs“操作”列“启动作业”，在弹出的新建作业页面，填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。
Notebook中上传文件提示大小受限时，您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook 在创建Notebook时，如果“存储配置”选择的是“OBS”。Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OB
Notebook的名称。名称长度1-63，仅支持小写字母、数字、中划线(-)，开始只能是小写字母，结束只能是小写字母或数字。 描述 Notebook的简要描述。 镜像类型 支持系统镜像和自定义镜像。 工作环境 选择系统镜像时，工作环境选择“PY3”。 自定义镜像：当提供的镜像无法满足您的需求时，可以使用自己
当在Notebook中上传文件提示大小受限时，您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook Notebook列表中所有文件的读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作，即Notebook中的数据和被挂载的OB
列描述，非必填，最大长度1024 type: Long # 列类型，必填，支持Long，String，Double三种类型 nullable: false # 列是否允许为空，必填
弹出的新建作业页面，填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。
件，并同时输出task实例列表。 --log -g 否 本地存放task日志的路径，必须与--task一起使用以获取作业某一task的日志。 --task -a 否 task名称。如果是并发的task，那么默认获取索引号为0的task实例，如果要查看别的实例，格式： --task
应的标签。 超时时间：作业运行时间超过设置时间时，认为超时，默认1440分钟，最大可设置为144000分钟，即作业运行至多100天。 加速类型： 加速效率：IO加速>本地盘加速>无 无：作业运行于OBS中，不使用加速。 IO加速：IO加速使用弹性文件服务（SFS）提供高性能的数据
vcf文件时，文件编码格式使用UTF-8。 为保证查询性能，建议数据库行数小于500万行，若超过该量级，建议拆分数据库。 导入数据文件大小建议小于1GB。 新增的double类型数据，double的取值范围是-2^1024 ~ +2^1024，也即-1.79E+308 ~ +1.79E+308。超出精度返回会保留小数点后16位的精度。
"url": "https://x.x.x.x/v1/0xxx/notebooks/xxx/services/notebook", "flavor": { "cpu": 1.0, "gpu": 0.0, "memory": 2.0 }, "status":
作业设置完成后，会显示流程中的各个应用信息，再此可以指定实际的运行参数。 图7 NGS流程 单击图标，可设置数据来源，可以指定File或者Directory类型参数。这里我们将NA12878目录下的两个fastq文件分别指定成fastp-file1和fastp-file2。 图8 设置fastp输入数据
参数说明 参数 简写 是否必选 说明 task-id 不涉及 否 任务id，如果不传，那么获取的是任务列表。 --type -t 否 查询类型。 默认detail。 取值：logs、detail 。 logs：获取task日志。 detail：获取task详情，用于获取task列表。
新建研究 填写任务的基本信息，包括选择任务所属项目，研究的名称和描述。 图2 基本信息 选择配体分子和受体蛋白。 作业名称：自定义名称 。 类型：选择小分子化合物。 流程：选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。 配体分子：配体分子文件，支持SMILES、SD
数据作业”中查看任务的执行状态。同时，平台针对该类任务支持您在“数据中心 > 数据作业”中查看任务的执行信息。在数据作业页面，支持通过作业类型、状态、创建时间、完成时间来进行搜索。 数据作业支持取消、删除、重试操作，三种操作均支持批量操作。 取消：一个数据作业中，单个数据操作执行
4做Variant Calling，输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制，输出变异数目，变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对
单击“操作”列的“打开”，进入Notebook开发页面。 图1 Notebook开发页面 选择不同的AI引擎新建文件 打开Notebook实例后，进入Notebook开发页面，在“File”页签下，单击文件夹名称进入子级。 您可以单击右上角“New”，然后选择AI引擎“Python
开发”页面，单击“创建Notebook”，参考表 参数说明填写信息。 表1 参数说明 参数名称 说明 名称 Notebook的名称。 描述 Notebook的简要描述。 镜像类型 选择“自定义”镜像。 工作环境 选择“autogenome”镜像。 CPU 设置CPU为8.0核。 GPU 设置GPU为1.0。 内存 设置内存大于50G。
在“消息中心”中查看任务的执行状态。同时，平台针对该类任务支持您在“作业 > 数据作业”中查看任务的执行信息。在数据作业页面，支持通过作业类型、创建者、状态、创建时间、完成时间来进行搜索。 数据作业支持取消、删除、重试操作，三种操作均支持批量操作。 取消：一个数据作业中，单个数据
应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程 步骤1：对应用进行分析 步骤2：准备应用运行环境 步骤2：准备应用运行环境 步骤2：准备应用运行环境 更多 云服务器卡顿 应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程 步骤1：对应用进行分析 步骤2：准备应用运行环境 更多 Ping不通 应用容器化改造介绍 应用容器化改造流程
进行口袋位置预测。 全局对接 将整个受体作为口袋位置。 自定义 手动修改口袋位置和大小。 padding 口袋位置放大多少尺寸。 对接引擎类型：DSDP、AutoDock Vina。 单击“下一步”，进入优化设置页面。 图7 优化设置页面（1） 图8 优化设置页面（2） 单击“提交”。
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