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yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 修改应用yaml模板。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。 修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app:
file 测序得到的fastq2文件。 ref-dir directory 参考基因组序列。 seq-platform string 测序平台，如MGI、Illumina。 sample-id string 文件前缀，如NA12878。 输出参数 sorted-bam file 比对和排序之后得到的bam文件。
继续前往xxxx（不安全）”，页面显示“403 : Forbidden”，然后返回Notebook列表页面。 请不要使用无痕浏览器访问。 返回平台操作界面，在Notebook列表中，选择已经创建的Notebook，单击“操作”列的“打开”，进入Notebook开发页面。 图1 Notebook开发页面
享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 存在一个创建好的项目。 操作步骤 添加项目成员有两种不同的方法，请任选其中一种方法操作。
错误码（医疗智能体与盘古辅助制药平台） 当您调用API时，如果遇到“APIGW”开头的错误码，请参见API网关错误码进行处理。 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.01040001 Invalid template content. 检查模板内容是否符合格式要求。
面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。EIHealth平台使用容器镜像服务（Software Repository for Container，简称SWR）进行简单易用、安全可靠的镜像管理。 应用 EIHealth平台的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运
邮箱设置 设置消息发送邮箱 通过设置邮箱，发送平台的通知。设置邮箱功能只有管理员用户可进行操作。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”，设置邮件配置。 服务器地址：邮箱开通SMTP功能时的服务器地址，不同邮箱开通SMTP方式不同，请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址
步骤4：使用AutoGenome 步骤1：订阅镜像 使用AutoGenome镜像前，需要您在资产市场中订阅该镜像。 登录医疗智能体，进入基因平台。 在“资产市场”中查找“autogenome”镜像。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该镜像。 订阅的镜像将显示在“项目管理 > 镜像”页面的镜像列表中。
以用户组的方式导入时，用户组里已经导入到平台的用户，不算统计个数。例如，用户组A里50个用户，10个已经导入平台， 那么统计时，只会显示已选择40个用户。 IAM平台限制一个IAM用户不能加入超过10个用户组，而导入时还会再加入医疗用户组。如果IAM用户在导入平台之前就已经加入了10个用户组，则导入的时候会失败。
归档数据 平台支持数据的归档机制，您可以将核心数据进行归档，避免误删造成损失。 在“数据”页面单击“归档”，进入归档数据页面。 图1 选择归档 填写归档的参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型
用户管理 用户管理介绍 创建子用户 导入用户 登录平台方式 管理用户 父主题： 用户指南（基因平台）
使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 使用AutoGenome镜像 genomeagent镜像 父主题： 用户指南（基因平台）
Nextflow 简介 安装/卸载Nextflow 新建流程 管理流程 新建作业 管理作业 约束限制 作业执行失败排查思路 父主题： 用户指南（基因平台）
系统设置 安全设置 商标设置 作业消息设置 消息中心 邮箱设置 系统标签管理 个人资源配额 数据归档配置 父主题： 用户指南（基因平台）
自动作业 前提条件 在“工具”中完成流程创建。 在“数据库”中完成样本集的数据库创建。数据库的每一行对应一个任务，如果满足触发条件，就会在平台自动运行，并在分析任务列表添加一条记录。 创建自动作业 在“作业”页面左侧，单击“自动作业”页签。 在页面左上角单击“新建自动作业”。 设
使用Docking Summary流程 分子对接（molecular docking ）是分子模拟的重要方法之一，其本质是两个或多个分子之间的识别过程，其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。分子对接方法在药物设计、材料设计等领域有广泛的应用。 在药物分子产生药效反应的过程中，药
workflows 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。
kflow_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。
数据归档配置 设置平台数据归档的区域。 在账号下面选择“系统设置”。 图1 选择系统设置 进入系统设置页面，设置数据归档配置区域。 图2 配置数据归档区域 父主题： 系统设置
_id}/apps 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。
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